SOHLH2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达图谱
SOHLH2是调控生殖细胞发育的关键转录因子,其突变与男性不育及睾丸生殖细胞肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SOHLH2 |
|---|---|
| 基因全名 | spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 13q13.3 |
| NCBI Gene ID | 79137 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79137 |
| Ensembl ID | ENSG00000102738 |
| UniProt ID | Q9NX45 |
| OMIM ID | 610102 |
| HGNC ID | 18455 |
| 基因别名 | bHLHe3, C13orf1, FLJ12735, MGC126851 |
基因功能与研究简介
SOHLH2(spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2)基因编码一种碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子,主要在睾丸和卵巢中表达,对生殖细胞发育至关重要。SOHLH2与SOHLH1形成异源二聚体,调控减数分裂相关基因的表达。该基因的突变与男性不育(如无精子症)和睾丸生殖细胞肿瘤(如精原细胞瘤)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 男性不育(无精子症) | SOHLH2突变导致蛋白功能丧失,影响精子发生,导致无精子症。 | ClinVar, OMIM |
| 睾丸生殖细胞肿瘤(精原细胞瘤) | SOHLH2表达异常可能参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | COSMIC, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达或未检测到 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| NTERA-2(畸胎瘤细胞系) | 暂无可靠数据 | 表达 |
| TCam-2(精原细胞瘤细胞系) | 暂无可靠数据 | 表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.346C>T (p.Arg116Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.487A>G (p.Lys163Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失):突变导致蛋白功能缺失或显著降低,如无义突变产生截短蛋白。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明SOHLH2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明SOHLH2存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding) | • GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity |
| • RNA polymerase II-specific) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) | • GO:0007283 (spermatogenesis) |
| • GO:0007292 (female gamete generation) |
相关通路
• 暂无明确Pathway ID
蛋白质功能简介
SOHLH2蛋白属于bHLH转录因子家族,包含一个基本的DNA结合结构域和一个螺旋-环-螺旋二聚化结构域。它主要在睾丸精原细胞和卵巢卵母细胞中表达,与SOHLH1形成异源二聚体,调控减数分裂和生殖细胞分化相关基因的转录。SOHLH2对精子发生和卵子发生至关重要,其功能缺失可导致生殖障碍。
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