SP100基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SP100是核体蛋白,参与转录调控和自身免疫反应,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SP100
基因全名 SP100 nuclear antigen
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q37.1
NCBI Gene ID 6672 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6672
Ensembl ID ENSG00000115956
UniProt ID P23497
OMIM ID 604402
HGNC ID 11206
基因别名 SP100, SP100 nuclear antigen, FLJ00391, MGC167956

基因功能与研究简介

SP100基因编码一种核体蛋白,主要定位于核体(PML nuclear bodies),参与转录调控、细胞凋亡和免疫应答。SP100蛋白包含一个SAND结构域和一个PHD型锌指结构,可能作为转录调节因子。该基因的异常表达与自身免疫性疾病(如原发性胆汁性胆管炎)和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
原发性胆汁性胆管炎 SP100是原发性胆汁性胆管炎(PBC)的主要自身抗原,患者血清中常存在抗SP100抗体,参与疾病发病机制。 已明确致病
肝细胞癌 SP100在肝细胞癌中表达下调,可能通过影响细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生。 具有较强研究证据
乳腺癌 SP100在乳腺癌中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促进因子,具体机制尚在研究中。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) SNV 暂无可靠数据 可能影响蛋白结构,功能影响未知
c.567C>T (p.Arg189Trp) SNV 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,需进一步研究
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致SP100蛋白功能丧失或降低,可能影响转录调控和细胞凋亡。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明SP100存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前暂无明确证据表明SP100存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005634 (nucleus) • GO:0003677 (DNA binding)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0045892 (negative regulation of transcription
• DNA-templated)

相关通路

Pathway: hsa05169 (Epstein-Barr virus infection)
Pathway: hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

SP100蛋白是一种核体蛋白,主要定位于PML核体,参与转录调控、细胞凋亡和免疫应答。该蛋白包含SAND结构域和PHD型锌指结构,可能作为转录调节因子。SP100在自身免疫性疾病(如原发性胆汁性胆管炎)中作为自身抗原,在癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生。

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