SPATA2L基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SPATA2L是精子发生相关蛋白2类似物,参与NF-κB信号通路调控,与肿瘤及炎症性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SPATA2L
基因全名 spermatogenesis associated 2 like
基因类型 protein coding
染色体位置 16q24.1
NCBI Gene ID 124044 ncbi.nlm.nih.gov/gene/124044
Ensembl ID ENSG00000140945
UniProt ID Q6ZRY4
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:33844
基因别名 SPATA2L, C16orf55

基因功能与研究简介

SPATA2L(spermatogenesis associated 2 like)基因位于人类16号染色体q24.1区域,编码一个含有438个氨基酸的蛋白质。该蛋白与SPATA2(spermatogenesis associated 2)具有同源性,但功能尚不完全明确。研究表明SPATA2L参与NF-κB信号通路的调控,可能通过调节LUBAC(linear ubiquitin chain assembly complex)的活性来影响炎症和免疫反应。SPATA2L在多种组织中表达,尤其在睾丸中高表达,提示其在精子发生中可能发挥作用。此外,SPATA2L的异常表达与多种肿瘤相关,如肝癌、肺癌等,但其具体机制仍需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 SPATA2L在肝癌组织中表达上调,可能通过激活NF-κB信号通路促进肿瘤进展。 较强研究证据
肺腺癌 SPATA2L在肺腺癌中表达异常,与患者预后相关,可能作为潜在生物标志物。 潜在关联
炎症性疾病 SPATA2L参与NF-κB信号通路调控,可能影响炎症反应,但具体疾病关联尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567C>T (p.Pro189Leu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005829 (cytosol) • GO:0007254 (JNK cascade)
• GO:0033209 (tumor necrosis factor-mediated signaling pathway)

相关通路

NF-kappa B signaling pathway (KEGG: hsa04064)
TNF signaling pathway (KEGG: hsa04668)

蛋白质功能简介

SPATA2L蛋白由438个氨基酸组成,分子量约49 kDa。该蛋白含有多个磷酸化位点,可能参与信号转导。SPATA2L与SPATA2具有同源性,可能通过其C端结构域与LUBAC复合物相互作用,调节线性泛素化过程,从而影响NF-κB信号通路的激活。此外,SPATA2L在睾丸中高表达,提示其在精子发生中可能具有特定功能,但具体机制尚待阐明。

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