SPATS1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SPATS1基因编码一种在精子发生中起关键作用的蛋白,其突变可能导致男性不育,并可能与某些癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SPATS1 |
|---|---|
| 基因全名 | spermatogenesis associated serine rich 1 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 6q21 |
| NCBI Gene ID | 221409 ncbi.nlm.nih.gov/gene/221409 |
| Ensembl ID | ENSG00000163349 |
| UniProt ID | Q5VXU1 |
| OMIM ID | 609949 |
| HGNC ID | 26225 |
| 基因别名 | SPATA1, FLJ23577 |
基因功能与研究简介
SPATS1基因编码一种富含丝氨酸的蛋白,主要在睾丸中表达,参与精子发生过程。研究表明SPATS1可能通过调控细胞凋亡和增殖影响精子形成,其表达异常与男性不育相关。此外,SPATS1在多种肿瘤中表达异常,提示其可能参与肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 男性不育 | SPATS1突变可能导致精子发生障碍,影响生育能力。 | ClinVar, OMIM |
| 癌症 | SPATS1在多种肿瘤中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或癌基因参与肿瘤发生。 | COSMIC, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与男性不育相关 |
| c.456delC (p.Pro153LeufsTer2) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失,与男性不育相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能破坏精子发生过程。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0007283 (spermatogenesis) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
SPATS1蛋白富含丝氨酸,定位于细胞核和细胞质,在睾丸中高表达。其功能与精子发生密切相关,可能参与调控细胞凋亡和增殖。SPATS1的异常表达与男性不育和多种癌症相关,但具体分子机制尚待深入研究。