SPECC1L基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SPECC1L基因编码细胞骨架相关蛋白,参与细胞迁移和分裂,其突变与眼、颌面及心脏发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SPECC1L |
|---|---|
| 基因全名 | sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q11.23 |
| NCBI Gene ID | 79884 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79884 |
| Ensembl ID | ENSG00000100219 |
| UniProt ID | Q69YQ0 |
| OMIM ID | 614147 |
| HGNC ID | 29022 |
| 基因别名 | CYTSA, HCMST, SPECC1L-1 |
基因功能与研究简介
SPECC1L基因编码一种含有calponin同源结构域和卷曲螺旋结构域的蛋白质,该蛋白参与细胞骨架组织、细胞迁移和细胞分裂等过程。SPECC1L在胚胎发育中发挥重要作用,其突变与多种先天性发育异常相关,包括眼、颌面及心脏畸形。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 眼-颌面-心-牙综合征 | 致病性变异导致功能丧失,影响神经嵴细胞迁移和颅面发育 | ClinVar, OMIM |
| 先天性心脏病 | 可能通过影响心脏神经嵴细胞迁移导致心脏发育异常 | ClinVar, OMIM |
| 腭裂 | 与SPECC1L突变相关,影响腭部融合过程 | ClinVar, OMIM |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.634C>T (p.Arg212Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1045G>A (p.Gly349Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致提前终止密码子,产生截短蛋白,功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005813 (centrosome) |
| • GO:0005856 (cytoskeleton) | • GO:0007010 (cytoskeleton organization) |
| • GO:0030036 (actin cytoskeleton organization) | • GO:0007049 (cell cycle) |
| • GO:0051301 (cell division) |
相关通路
• Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)
• Cell cycle (KEGG: hsa04110)
蛋白质功能简介
SPECC1L蛋白包含calponin同源结构域和卷曲螺旋结构域,定位于细胞质和中心体,参与细胞骨架组织、细胞迁移和细胞分裂。在胚胎发育中,SPECC1L对神经嵴细胞的迁移至关重要,其功能异常可导致颅面及心脏发育缺陷。