SPG11基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SPG11基因编码spatacsin蛋白,参与溶酶体功能与脂质代谢,其突变导致遗传性痉挛性截瘫11型及肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病。
基因信息卡
| 基因符号 | SPG11 |
|---|---|
| 基因全名 | SPG11 vesicle trafficking associated, spatacsin |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 15q21.1 |
| NCBI Gene ID | 23184 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23184 |
| Ensembl ID | ENSG00000133104 |
| UniProt ID | Q96JI7 |
| OMIM ID | 610844 |
| HGNC ID | 11246 |
| 基因别名 | ALS5, CMT2X, KIAA1840, SPG11 |
基因功能与研究简介
SPG11基因编码spatacsin蛋白,该蛋白在细胞内参与囊泡运输、溶酶体功能和脂质代谢等过程。SPG11基因突变是遗传性痉挛性截瘫11型(SPG11)的主要致病原因,也与肌萎缩侧索硬化(ALS5)和腓骨肌萎缩症(CMT2X)等神经退行性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 遗传性痉挛性截瘫11型(SPG11) | 致病机制:SPG11基因突变导致spatacsin蛋白功能缺失,影响溶酶体运输和自噬,导致轴突退行性变。 | 已明确致病(OMIM 610844) |
| 肌萎缩侧索硬化5型(ALS5) | 致病机制:SPG11基因突变导致运动神经元退行性变,具体机制与溶酶体功能障碍相关。 | 已明确致病(OMIM 602099) |
| 腓骨肌萎缩症2X型(CMT2X) | 致病机制:SPG11基因突变导致周围神经轴突变性,与溶酶体功能异常有关。 | 已明确致病(OMIM 616668) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.733_734delAT (p.Met245ValfsTer2) | 移码突变 | 常见于SPG11患者 | Loss of Function |
| c.1297C>T (p.Arg433Ter) | 无义突变 | 常见于SPG11患者 | Loss of Function |
| c.2674A>T (p.Lys892Ter) | 无义突变 | 常见于SPG11患者 | Loss of Function |
| c.5860C>T (p.Arg1954Ter) | 无义突变 | 常见于SPG11患者 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SPG11基因突变多为功能缺失型,导致spatacsin蛋白截短或缺失,影响溶酶体功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005768 (endosome) |
| • GO:0005764 (lysosome) | • GO:0006886 (intracellular protein transport) |
| • GO:0016192 (vesicle-mediated transport) | • GO:0006996 (organelle organization) |
相关通路
• Autophagy (KEGG: hsa04140)
• Endocytosis (KEGG: hsa04144)
蛋白质功能简介
spatacsin蛋白由SPG11基因编码,包含2443个氨基酸,分子量约270 kDa。该蛋白在细胞内参与囊泡运输和溶酶体功能,与自噬和脂质代谢密切相关。spatacsin蛋白的C端区域包含一个跨膜结构域,可能参与膜结合。