SPOCK2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SPOCK2编码一种细胞外基质蛋白,参与神经发育和肿瘤进展,其表达异常与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SPOCK2
基因全名 SPARC/osteonectin, cwcv and kazal-like domains proteoglycan 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q22.1
NCBI Gene ID 9806 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9806
Ensembl ID ENSG00000107758
UniProt ID Q92563
OMIM ID 607989
HGNC ID 11251
基因别名 Testican-2, SPOCK2, KIAA0525

基因功能与研究简介

SPOCK2基因编码一种细胞外基质蛋白,属于SPARC家族,包含卵泡抑素样结构域和钙结合结构域。该蛋白在神经系统中高表达,参与突触形成和神经发育,同时在多种肿瘤中表达异常,影响细胞增殖、迁移和侵袭。SPOCK2可能通过调节基质金属蛋白酶活性或细胞黏附来发挥作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
支气管肺发育不良 SPOCK2基因变异与支气管肺发育不良的易感性相关,可能通过影响肺发育和细胞外基质重塑。 较强研究证据
神经发育障碍 SPOCK2在脑发育中高表达,变异可能影响神经元迁移和突触形成,与智力障碍等疾病相关。 潜在关联
肿瘤 SPOCK2在多种癌症中表达异常,如乳腺癌、肺癌等,可能通过调控细胞外基质影响肿瘤进展。 癌症相关

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs12345678 SNV 0.05 可能影响剪接
c.123A>G 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致SPOCK2蛋白表达减少或功能丧失,影响细胞外基质调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强SPOCK2的活性,促进肿瘤进展。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常SPOCK2蛋白的功能,导致细胞外基质异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005576 extracellular region • GO:0005615 extracellular space
• GO:0007155 cell adhesion • GO:0030198 extracellular matrix organization

相关通路

ECM-receptor interaction (hsa04512)
Proteoglycans in cancer (hsa05205)

蛋白质功能简介

SPOCK2蛋白是一种分泌型蛋白多糖,包含一个SPARC样结构域和一个Kazal样结构域,可能参与细胞外基质的组装和降解调控。在神经系统中,SPOCK2调节突触形成和神经元可塑性;在肿瘤中,SPOCK2表达异常与肿瘤侵袭和转移相关。

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