SPOP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SPOP基因编码E3泛素连接酶复合物的底物识别亚基,参与蛋白质降解调控,其突变与多种肿瘤发生密切相关。

基因信息卡

基因符号 SPOP
基因全名 Speckle Type BTB/POZ Protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q21.33
NCBI Gene ID 8405 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8405
Ensembl ID ENSG00000121067
UniProt ID O43791
OMIM ID 602650
HGNC ID 11254
基因别名 ['BTBD32', 'TEF2']

基因功能与研究简介

SPOP基因编码的蛋白质是Cullin3-RING泛素连接酶复合物的底物识别亚基,通过BTB/POZ结构域与Cullin3结合,通过MATH结构域识别底物,介导底物的泛素化降解。SPOP在多种细胞过程中发挥关键作用,包括DNA损伤修复、细胞周期调控、凋亡和转录调控。SPOP突变常见于前列腺癌、子宫内膜癌等肿瘤,导致底物降解异常,促进肿瘤发生发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
前列腺癌 SPOP突变导致底物蛋白(如AR、MYC等)积累,激活致癌信号通路,促进肿瘤发生。 已明确致病
子宫内膜癌 SPOP突变导致底物降解异常,影响细胞增殖和凋亡,参与肿瘤发生。 已明确致病
胃癌 SPOP表达下调或突变与胃癌进展相关,可能通过影响底物降解促进肿瘤。 具有较强研究证据
肾细胞癌 SPOP突变或表达异常与肾癌发生相关,但具体机制尚需进一步研究。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
前列腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
子宫内膜 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
LNCaP 暂无可靠数据 前列腺癌细胞系
MDA-MB-231 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
p.F133V 错义突变 前列腺癌中约5-10% 可能影响底物识别,导致功能获得或显性负效应
p.F133L 错义突变 前列腺癌中约2-5% 可能影响底物识别,导致功能获得或显性负效应
p.S119N 错义突变 子宫内膜癌中约3% 可能影响底物识别,导致功能获得或显性负效应
p.Y87C 错义突变 前列腺癌中约1-2% 可能影响底物识别,导致功能获得或显性负效应
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

部分SPOP突变可能导致功能丧失,降低底物降解能力,但主要突变类型可能为显性负效应或功能获得。

Gain of Function(功能获得,GOF)

某些SPOP突变可能增强对特定底物的降解,导致肿瘤抑制因子降解增加,促进肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

SPOP突变常发生在底物结合域,可能干扰野生型SPOP功能,形成显性负效应,导致底物积累。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity
• GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0005634 nucleus
• GO:0005737 cytoplasm

相关通路

Cullin-RING ubiquitin ligase complex
Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
Prostate cancer pathway (KEGG: hsa05215)

蛋白质功能简介

SPOP蛋白包含N端MATH结构域和C端BTB/POZ结构域。MATH结构域负责底物识别,BTB/POZ结构域介导与Cullin3的结合。SPOP作为底物识别亚基,将底物招募至Cullin3-RING E3连接酶复合物,促进底物泛素化降解。SPOP的底物包括AR、MYC、BRD4、TRIM24等,参与调控细胞增殖、凋亡、DNA损伤修复等过程。SPOP突变导致底物降解异常,是多种肿瘤发生的关键驱动事件。

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