SPRED1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SPRED1是RAS-MAPK信号通路的关键负调控因子,其突变与神经纤维瘤病1型样综合征及多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SPRED1
基因全名 Sprouty-related EVH1 domain containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q14
NCBI Gene ID 161742 ncbi.nlm.nih.gov/gene/161742
Ensembl ID ENSG00000163634
UniProt ID Q7Z699
OMIM ID 609291
HGNC ID 20249
基因别名 Spred-1; FLJ31699; MGC131890

基因功能与研究简介

SPRED1基因编码Sprouty相关EVH1结构域蛋白1,是RAS-MAPK信号通路的负调控因子。SPRED1通过其EVH1结构域和Sprouty相关结构域,抑制RAS介导的ERK激活,从而调控细胞增殖、分化和凋亡。SPRED1功能丧失性突变导致神经纤维瘤病1型样综合征(NF1-like syndrome),并与多种癌症的发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经纤维瘤病1型样综合征 SPRED1功能丧失性突变导致RAS-MAPK通路过度激活,引起类似NF1的临床表现,如咖啡牛奶斑、腋窝雀斑、神经纤维瘤等。 已明确致病
黑色素瘤 SPRED1突变或表达下调导致RAS-MAPK通路异常激活,促进黑色素瘤的发生和进展。 具有较强研究证据
结直肠癌 SPRED1突变或表达下调与结直肠癌的发生相关,可能通过激活RAS-MAPK通路促进肿瘤生长。 具有较强研究证据
肺癌 SPRED1表达下调或突变在非小细胞肺癌中观察到,可能参与肿瘤的侵袭和转移。 潜在关联
白血病 SPRED1突变在部分白血病病例中被发现,可能通过激活RAS-MAPK通路促进白血病发生。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
皮肤 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.100C>T (p.Arg34Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
c.200_201del (p.Glu67fs) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
c.300G>A (p.Trp100Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SPRED1功能丧失性突变导致RAS-MAPK通路过度激活,是疾病发生的主要机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SPRED1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SPRED1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0007165 (signal transduction)
• GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation) • GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation)
• GO:0000165 (MAPK cascade)

相关通路

RAS-MAPK signaling pathway (KEGG: hsa04010)
Signaling by Receptor Tyrosine Kinases (Reactome: R-HSA-9006934)

蛋白质功能简介

SPRED1蛋白包含一个EVH1结构域和一个Sprouty相关结构域。EVH1结构域介导与RAS-GTP的相互作用,Sprouty相关结构域参与负调控RAS-MAPK信号通路。SPRED1通过抑制RAS介导的ERK磷酸化,调控细胞增殖和分化。

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