SPRED1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SPRED1是RAS-MAPK信号通路的关键负调控因子,其突变与神经纤维瘤病1型样综合征及多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SPRED1 |
|---|---|
| 基因全名 | Sprouty-related EVH1 domain containing 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q14 |
| NCBI Gene ID | 161742 ncbi.nlm.nih.gov/gene/161742 |
| Ensembl ID | ENSG00000163634 |
| UniProt ID | Q7Z699 |
| OMIM ID | 609291 |
| HGNC ID | 20249 |
| 基因别名 | Spred-1; FLJ31699; MGC131890 |
基因功能与研究简介
SPRED1基因编码Sprouty相关EVH1结构域蛋白1,是RAS-MAPK信号通路的负调控因子。SPRED1通过其EVH1结构域和Sprouty相关结构域,抑制RAS介导的ERK激活,从而调控细胞增殖、分化和凋亡。SPRED1功能丧失性突变导致神经纤维瘤病1型样综合征(NF1-like syndrome),并与多种癌症的发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经纤维瘤病1型样综合征 | SPRED1功能丧失性突变导致RAS-MAPK通路过度激活,引起类似NF1的临床表现,如咖啡牛奶斑、腋窝雀斑、神经纤维瘤等。 | 已明确致病 |
| 黑色素瘤 | SPRED1突变或表达下调导致RAS-MAPK通路异常激活,促进黑色素瘤的发生和进展。 | 具有较强研究证据 |
| 结直肠癌 | SPRED1突变或表达下调与结直肠癌的发生相关,可能通过激活RAS-MAPK通路促进肿瘤生长。 | 具有较强研究证据 |
| 肺癌 | SPRED1表达下调或突变在非小细胞肺癌中观察到,可能参与肿瘤的侵袭和转移。 | 潜在关联 |
| 白血病 | SPRED1突变在部分白血病病例中被发现,可能通过激活RAS-MAPK通路促进白血病发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.200_201del (p.Glu67fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.300G>A (p.Trp100Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SPRED1功能丧失性突变导致RAS-MAPK通路过度激活,是疾病发生的主要机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SPRED1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SPRED1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation) | • GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation) |
| • GO:0000165 (MAPK cascade) |
相关通路
• RAS-MAPK signaling pathway (KEGG: hsa04010)
• Signaling by Receptor Tyrosine Kinases (Reactome: R-HSA-9006934)
蛋白质功能简介
SPRED1蛋白包含一个EVH1结构域和一个Sprouty相关结构域。EVH1结构域介导与RAS-GTP的相互作用,Sprouty相关结构域参与负调控RAS-MAPK信号通路。SPRED1通过抑制RAS介导的ERK磷酸化,调控细胞增殖和分化。