SPTSSA基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SPTSSA是丝氨酸棕榈酰转移酶复合物的关键亚基,参与鞘脂从头合成,其突变与遗传性感觉神经病和皮肤屏障缺陷相关。

基因信息卡

基因符号 SPTSSA
基因全名 serine palmitoyltransferase small subunit A
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q42.3
NCBI Gene ID 171546 ncbi.nlm.nih.gov/gene/171546
Ensembl ID ENSG00000100823
UniProt ID Q969W0
OMIM ID 613540
HGNC ID 20323
基因别名 SSSPA, hSSPT, SPTLC3

基因功能与研究简介

SPTSSA基因编码丝氨酸棕榈酰转移酶(SPT)复合物的小亚基A。SPT是鞘脂从头合成的限速酶,催化丝氨酸和棕榈酰辅酶A缩合生成3-酮二氢鞘氨醇。SPTSSA作为SPT复合物的调节亚基,对酶的活性和底物选择性至关重要。SPTSSA突变可导致鞘脂合成异常,与遗传性感觉神经病(HSN)和皮肤屏障缺陷相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
遗传性感觉神经病1型(HSN1) SPTSSA突变导致SPT活性异常,影响鞘脂合成,进而损害神经元功能。 已明确致病
皮肤屏障缺陷 SPTSSA功能缺失导致角质层鞘脂缺乏,影响皮肤屏障完整性。 具有较强研究证据
癌症 SPTSSA在多种癌症中表达异常,可能通过调节鞘脂代谢影响肿瘤进展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HaCaT 暂无可靠数据 角质形成细胞
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.58G>A (p.Gly20Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或SPT复合物组装
c.112C>T (p.Arg38Cys) 错义突变 罕见 可能影响底物结合或催化活性
c.199G>A (p.Gly67Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致SPT活性降低或丧失,影响鞘脂合成。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

可能通过干扰SPT复合物组装发挥显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004759 (serine C-palmitoyltransferase activity) • GO:0006672 (ceramide biosynthetic process)
• GO:0005783 (endoplasmic reticulum) • GO:0016020 (membrane)

相关通路

Sphingolipid metabolism (KEGG: hsa00600)
Sphingolipid de novo biosynthesis (Reactome: R-HSA-1660661)

蛋白质功能简介

SPTSSA蛋白是丝氨酸棕榈酰转移酶复合物的调节亚基,与催化亚基SPTLC1和SPTLC2形成异源三聚体。SPTSSA对SPT酶的活性和底物选择性至关重要,其表达水平影响鞘脂合成速率。SPTSSA突变可导致鞘脂代谢异常,与遗传性感觉神经病和皮肤屏障缺陷相关。

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