SRGAP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SRGAP3编码SLIT-ROBO Rho GTPase激活蛋白3,参与神经元迁移和轴突导向,其突变与智力障碍和肾母细胞瘤相关。

基因信息卡

基因符号 SRGAP3
基因全名 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 3p25.3
NCBI Gene ID 9901 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9901
Ensembl ID ENSG00000114013
UniProt ID O43295
OMIM ID 606525
HGNC ID 19747
基因别名 ARHGAP14, KIAA0411, MEGAP, WRP

基因功能与研究简介

SRGAP3基因编码SLIT-ROBO Rho GTPase激活蛋白3,属于Rho GTPase激活蛋白家族。该蛋白在神经系统中高表达,参与调控Rac1和Cdc42的活性,影响神经元迁移、轴突导向和树突棘形态发生。SRGAP3的突变与智力障碍、小头畸形和肾母细胞瘤(Wilms瘤)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
智力障碍 SRGAP3突变导致蛋白功能丧失,影响神经元迁移和突触形成,导致智力障碍。 已明确致病
小头畸形 SRGAP3突变影响大脑皮层发育,导致头围减小。 已明确致病
肾母细胞瘤 SRGAP3在肾母细胞瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制基因参与发病。 具有较强研究证据
自闭症谱系障碍 SRGAP3变异可能增加自闭症风险,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
U87 暂无可靠数据 胶质母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2053C>T (p.Arg685Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1096_1097del (p.Val366fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.1741G>A (p.Gly581Arg) 错义突变 罕见 可能为Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致蛋白功能丧失或显著降低,影响Rho GTPase信号通路,导致神经元发育异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SRGAP3存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SRGAP3存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005096 GTPase activator activity • GO:0005515 protein binding
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0005886 plasma membrane
• GO:0007399 nervous system development • GO:0030036 actin cytoskeleton organization
• GO:0043547 positive regulation of GTPase activity

相关通路

Axon guidance (KEGG: hsa04360)
Signaling by Rho GTPases (Reactome: R-HSA-194315)

蛋白质功能简介

SRGAP3蛋白包含一个F-BAR结构域和一个RhoGAP结构域,通过其RhoGAP结构域负调控Rac1和Cdc42的活性。在神经元中,SRGAP3参与调控肌动蛋白细胞骨架动态,影响神经元迁移和树突棘形态。SRGAP3的缺失或突变导致神经元发育异常,与多种神经系统疾病相关。

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