SRM基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SRM基因编码亚精胺合酶,是多胺生物合成途径的关键酶,参与细胞增殖与分化,其异常与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SRM
基因全名 spermidine synthase
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p36.22
NCBI Gene ID 6723 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6723
Ensembl ID ENSG00000116679
UniProt ID P19623
OMIM ID 182891
HGNC ID 11296
基因别名 SPDSY, SPS1

基因功能与研究简介

SRM基因编码亚精胺合酶,该酶催化腐胺转化为亚精胺,是多胺生物合成途径中的关键酶。多胺在细胞增殖、分化、凋亡等过程中发挥重要作用。SRM基因的异常表达或突变与多种疾病相关,包括癌症、神经系统疾病等。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SRM表达异常与多种癌症相关,如结直肠癌、乳腺癌等,可能通过影响多胺水平促进肿瘤生长。 较强研究证据
神经系统疾病 SRM突变可能导致多胺代谢异常,与神经发育障碍相关,但具体机制尚不明确。 潜在关联
多胺代谢异常 SRM功能缺失导致亚精胺合成减少,影响细胞功能,可能引起代谢性疾病。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
MCF7 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响酶活性,但功能影响需进一步研究
c.456C>T (p.Arg152Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性,导致功能部分丧失
c.789delC (p.Pro263LeufsTer5) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能引起功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,酶活性降低或缺失,影响多胺合成。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SRM存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SRM存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004766 (spermidine synthase activity) • GO:0008295 (spermidine biosynthetic process)
• GO:0005829 (cytosol) • GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

hsa00330 (Arginine and proline metabolism)
hsa00480 (Glutathione metabolism)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

SRM编码的亚精胺合酶是二聚体蛋白,催化腐胺和丙胺转移酶反应生成亚精胺。该酶在细胞质中发挥作用,其活性受多胺水平反馈调节。SRM蛋白在多种组织中表达,尤其在增殖活跃的细胞中表达较高。

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