SRP54基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SRP54是信号识别颗粒的核心组分,在蛋白质靶向和分泌中发挥关键作用,其突变与中性粒细胞减少症和Shwachman-Diamond样综合征相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SRP54 |
|---|---|
| 基因全名 | signal recognition particle 54 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q13.2 |
| NCBI Gene ID | 6729 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6729 |
| Ensembl ID | ENSG00000130203 |
| UniProt ID | P61011 |
| OMIM ID | 604857 |
| HGNC ID | 11301 |
| 基因别名 | 信号识别颗粒54kDa亚基 |
基因功能与研究简介
SRP54基因编码信号识别颗粒(SRP)的54 kDa亚基,是SRP复合物的核心成分。SRP54在核糖体上识别新生蛋白的信号肽,并引导核糖体-新生链复合物与内质网上的SRP受体结合,从而确保分泌蛋白和膜蛋白的正确靶向。SRP54的突变可导致蛋白质运输缺陷,进而引发多种疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体显性遗传性中性粒细胞减少症 | SRP54突变导致蛋白功能异常,影响中性粒细胞分化,导致中性粒细胞减少。 | 已明确致病 |
| Shwachman-Diamond样综合征 | SRP54突变导致胰腺外分泌功能不全、骨骼异常和骨髓衰竭,与Shwachman-Diamond综合征表型相似。 | 已明确致病 |
| 骨髓增生异常综合征 | SRP54突变可能增加骨髓增生异常综合征的风险,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 广泛表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.346G>A (p.Gly116Arg) | 错义突变 | 未知 | 可能影响GTPase活性,导致功能丧失 |
| c.554C>T (p.Thr185Met) | 错义突变 | 未知 | 可能影响蛋白稳定性,导致功能丧失 |
| c.1046G>A (p.Arg349His) | 错义突变 | 未知 | 可能影响信号肽结合,导致功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数SRP54突变导致功能丧失,影响SRP复合物的组装或信号肽识别,导致蛋白质运输缺陷。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SRP54突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分突变可能具有显性负效应,干扰野生型SRP54的功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005048 | • GO:0008312 |
| • GO:0005525 | • GO:0005786 |
| • GO:0006614 | • GO:0006616 |
| • GO:0006617 | • GO:0006886 |
| • GO:0016020 | • GO:0045047 |
相关通路
• 信号识别颗粒(SRP)依赖性共翻译蛋白靶向至膜(Reactome: R-HSA-1799339)
• 蛋白质靶向至内质网(KEGG: hsa04141)
蛋白质功能简介
SRP54蛋白是信号识别颗粒(SRP)的GTPase亚基,包含N端N结构域、中央G结构域和C端M结构域。N结构域和G结构域参与GTP结合和水解,M结构域负责结合信号肽。SRP54与SRP RNA及其他SRP蛋白组装成SRP复合物,在核糖体上识别新生蛋白的信号肽,并介导核糖体-新生链复合物与内质网上的SRP受体结合,确保蛋白质正确靶向。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|