SRPK1基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SRPK1是丝氨酸/精氨酸蛋白激酶家族成员,通过磷酸化SR蛋白调控RNA剪接,在癌症、血管生成和病毒感染中发挥重要作用。

基因信息卡

基因符号 SRPK1
基因全名 SRSF protein kinase 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 6p21.31
NCBI Gene ID 6732 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6732
Ensembl ID ENSG00000100030
UniProt ID Q96SB4
OMIM ID 602944
HGNC ID 11305
基因别名 SFRSK1, SRPK1

基因功能与研究简介

SRPK1(SRSF protein kinase 1)是丝氨酸/精氨酸蛋白激酶家族成员,特异性磷酸化富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子(SR蛋白),调控RNA剪接、mRNA输出和翻译。SRPK1在多种癌症中高表达,促进肿瘤细胞增殖、迁移和血管生成,并与病毒感染(如HIV)和视网膜新生血管疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SRPK1在多种癌症中过表达,通过磷酸化SR蛋白促进促血管生成因子(如VEGF)的剪接,增强肿瘤血管生成和生长。 较强研究证据
视网膜新生血管疾病 SRPK1通过调控VEGF剪接促进病理性血管生成,与年龄相关性黄斑变性(AMD)等疾病相关。 较强研究证据
HIV感染 SRPK1磷酸化病毒蛋白Rev,影响HIV RNA的核输出和病毒复制。 研究证据
其他潜在关联 SRPK1可能参与炎症和纤维化过程,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
乳腺 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Hela 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响激酶活性
c.567C>T (p.Arg189Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.890_891insA (p.Gln297fs) 移码突变 罕见 可能导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致SRPK1激酶活性降低或蛋白表达缺失,可能影响RNA剪接调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:增强SRPK1激酶活性或底物磷酸化,可能促进肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰野生型SRPK1功能,可能影响剪接调控。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity) • GO:0006397 (mRNA processing)
• GO:0008380 (RNA splicing) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

Pathway: mRNA Splicing - Major Pathway (Reactome: R-HSA-72163)
Pathway: VEGF signaling pathway (KEGG: hsa04370)

蛋白质功能简介

SRPK1蛋白由655个氨基酸组成,包含N端激酶结构域和C端调控结构域。它通过磷酸化SR蛋白(如SRSF1)的RS结构域,调控其亚细胞定位和活性,从而影响mRNA剪接。SRPK1在细胞质和细胞核中均有分布,其活性受磷酸化和蛋白相互作用调控。

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