SRRM1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SRRM1(丝氨酸/精氨酸重复基质蛋白1)是RNA剪接的关键调控因子,参与基因表达调控,与多种癌症和神经发育疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SRRM1
基因全名 Serine and Arginine Repetitive Matrix 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p36.11
NCBI Gene ID 10250 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10250
Ensembl ID ENSG00000133247
UniProt ID Q8IYB3
OMIM ID 604858
HGNC ID 11242
基因别名 SRM160, 160kD, 160 kDa, B4, FLJ41941, MGC134925

基因功能与研究简介

SRRM1(丝氨酸/精氨酸重复基质蛋白1)是一种核基质蛋白,属于SR样蛋白家族,参与前体mRNA的剪接调控。它通过与剪接因子相互作用,影响剪接体的组装和选择性剪接。SRRM1在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,SRRM1在细胞增殖、凋亡和应激反应中发挥重要作用,其异常表达与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)和神经发育疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 SRRM1过表达可能通过调控与细胞增殖和凋亡相关的基因剪接,促进肿瘤发生发展。 较强研究证据
肺癌 SRRM1在肺癌组织中表达上调,可能通过影响上皮-间质转化(EMT)相关基因的剪接,促进肿瘤侵袭和转移。 较强研究证据
神经发育障碍 SRRM1突变或表达异常可能影响神经元发育相关基因的剪接,与智力障碍和自闭症谱系障碍相关。 潜在关联
前列腺癌 SRRM1表达水平与前列腺癌的进展和预后相关,可能通过调控雄激素受体信号通路相关基因的剪接。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
乳腺 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确
c.567_568insC (p.Gln190ProfsTer23) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能为Loss of Function
c.890C>T (p.Pro297Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):移码突变导致蛋白截短,可能丧失剪接调控功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明SRRM1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明SRRM1突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 (mRNA splicing • via spliceosome)
• GO:0005681 (spliceosomal complex) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0003723 (RNA binding)

相关通路

Pathway: mRNA Splicing - Major Pathway (Reactome: R-HSA-72163)
Pathway: Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA (Reactome: R-HSA-72203)

蛋白质功能简介

SRRM1蛋白是一种核基质蛋白,含有多个RS(精氨酸-丝氨酸)重复序列,参与RNA剪接的调控。它作为剪接体组分,与U1 snRNP和SR蛋白相互作用,影响5'剪接位点的识别和剪接体的组装。SRRM1还参与DNA损伤应答和细胞周期调控,其表达水平的变化与肿瘤发生相关。

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