SRRM3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SRRM3是一种丝氨酸/精氨酸重复基质蛋白,参与RNA剪接调控,与神经发育和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SRRM3
基因全名 Serine/Arginine Repetitive Matrix 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q22.1
NCBI Gene ID 222183 ncbi.nlm.nih.gov/gene/222183
Ensembl ID ENSG00000177663
UniProt ID Q9UQ35
OMIM ID 617403
HGNC ID 26873
基因别名 FLJ38663, SRRM3

基因功能与研究简介

SRRM3(Serine/Arginine Repetitive Matrix 3)基因编码一种丝氨酸/精氨酸重复基质蛋白,属于SR相关蛋白家族。该蛋白定位于细胞核,参与前体mRNA的剪接调控,可能通过影响剪接因子活性来调节基因表达。SRRM3在神经组织中高表达,提示其在神经系统发育和功能中具有重要作用。此外,SRRM3的异常表达与多种癌症相关,可能作为潜在的生物标志物或治疗靶点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SRRM3突变可能影响RNA剪接,导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 SRRM3在多种癌症中表达异常,可能通过调控剪接影响肿瘤发生发展。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567delC (p.Leu190Trpfs*13) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变可能导致SRRM3蛋白活性降低或缺失,影响RNA剪接调控,可能与疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明SRRM3存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前暂无明确证据表明SRRM3存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006397 (mRNA processing) • GO:0008380 (RNA splicing)

相关通路

Pathway: mRNA Splicing (Reactome: R-HSA-72163)
Pathway: Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA (Reactome: R-HSA-72203)

蛋白质功能简介

SRRM3蛋白属于丝氨酸/精氨酸重复基质蛋白家族,含有多个RS结构域,参与RNA剪接的调控。该蛋白主要定位于细胞核,可能通过与其他剪接因子相互作用,影响前体mRNA的选择性剪接。SRRM3在神经组织中高表达,提示其在神经元分化或突触功能中具有重要作用。此外,SRRM3的异常表达与多种癌症相关,可能通过调控癌基因或抑癌基因的剪接影响肿瘤进展。

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