SRRM4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SRRM4(Serine/Arginine Repetitive Matrix 4)是一种神经特异性RNA剪接调节因子,在神经元分化、神经发育及小细胞肺癌等疾病中发挥关键作用。

基因信息卡

基因符号 SRRM4
基因全名 Serine/Arginine Repetitive Matrix 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q24.23
NCBI Gene ID 84530 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84530
Ensembl ID ENSG00000139767
UniProt ID Q8IYB8
OMIM ID 610067
HGNC ID 29383
基因别名 nSR100, FLJ38948

基因功能与研究简介

SRRM4(Serine/Arginine Repetitive Matrix 4)基因编码一种神经特异性RNA剪接调节因子,属于SR相关蛋白家族。该蛋白通过调控microexon的剪接,在神经元分化、神经发育及神经功能中发挥关键作用。SRRM4在神经内分泌细胞中高表达,并参与小细胞肺癌等肿瘤的发生发展。其异常表达与多种神经系统疾病和癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
小细胞肺癌 SRRM4在神经内分泌肿瘤中高表达,通过调控microexon剪接促进肿瘤细胞增殖和存活,与肿瘤侵袭性相关。 较强研究证据
神经发育障碍 SRRM4调控神经元分化相关基因的剪接,其功能异常可能导致神经发育异常,与自闭症谱系障碍等疾病相关。 潜在关联
精神分裂症 SRRM4表达异常可能影响神经递质受体等基因的剪接,与精神分裂症发病机制相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 低表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
NCI-H82 暂无可靠数据 小细胞肺癌细胞系,高表达
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系,高表达
HEK293 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567C>T (p.Pro189Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或剪接活性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变可能导致SRRM4蛋白活性降低或丧失,影响microexon剪接调控,进而导致神经发育异常或肿瘤抑制功能减弱。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变可能增强SRRM4的剪接调控活性,促进肿瘤细胞增殖或异常神经分化。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能产生干扰正常SRRM4功能的蛋白,抑制其剪接调控作用,导致相关疾病。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006397 mRNA processing • GO:0008380 RNA splicing
• GO:0005634 nucleus • GO:0003723 RNA binding

相关通路

Pathway: mRNA Splicing - Major Pathway (Reactome: R-HSA-72163)
Pathway: Neuronal System (Reactome: R-HSA-112316)

蛋白质功能简介

SRRM4蛋白是一种神经特异性RNA剪接调节因子,属于SR相关蛋白家族。该蛋白包含精氨酸/丝氨酸重复区域,能够结合RNA并调控microexon的剪接。SRRM4在神经元分化过程中促进特定外显子的包含,从而影响神经发育相关基因的表达。在肿瘤中,SRRM4的异常表达可导致剪接失调,促进肿瘤进展。

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