SRRM5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SRRM5(丝氨酸/精氨酸重复基质蛋白5)是一种参与RNA剪接调控的蛋白质编码基因,其突变可能与神经发育障碍和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SRRM5
基因全名 Serine/Arginine Repetitive Matrix 5
基因类型 Protein coding
染色体位置 19p13.2
NCBI Gene ID 100287596 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100287596
Ensembl ID ENSG00000204176
UniProt ID 暂无可靠数据
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:33733
基因别名 C19orf35, FLJ40296, SRRM5

基因功能与研究简介

SRRM5(丝氨酸/精氨酸重复基质蛋白5)是一种蛋白质编码基因,属于SR相关基质蛋白家族。该基因编码的蛋白质可能参与RNA剪接的调控,特别是在剪接体的组装和选择性剪接过程中发挥作用。SRRM5在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中表达较高。目前,关于SRRM5的功能研究相对有限,但已有研究表明其突变可能与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SRRM5突变可能导致剪接异常,影响神经发育相关基因的表达,从而引发智力障碍或发育迟缓。 ClinVar
癌症 SRRM5在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控癌基因或抑癌基因的选择性剪接参与肿瘤发生发展。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质功能,导致剪接异常
c.567delC (p.Leu189Trpfs*13) 移码突变 罕见 导致蛋白质截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变或剪接位点突变可能导致蛋白质功能丧失,影响RNA剪接调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明SRRM5突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SRRM5突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 (RNA binding) • GO:0006397 (mRNA processing)
• GO:0008380 (RNA splicing) • GO:0005634 (nucleus)

相关通路

Pathway: hsa03040 (Spliceosome)
Pathway: hsa05034 (Alcoholism)

蛋白质功能简介

SRRM5蛋白属于SR相关基质蛋白家族,含有多个精氨酸/丝氨酸重复结构域,可能参与RNA剪接的调控。该蛋白主要定位于细胞核,可能作为剪接体的辅助因子,调节mRNA前体的剪接过程。目前,关于SRRM5蛋白的具体功能研究较少,但基于其结构特征,推测其在基因表达调控中发挥重要作用。

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