SRSF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SRSF1是RNA剪接的关键调控因子,其异常表达与多种癌症及自身免疫疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SRSF1
基因全名 Serine and Arginine Rich Splicing Factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q22
NCBI Gene ID 6426 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6426
Ensembl ID ENSG00000136450
UniProt ID Q07955
OMIM ID 600812
HGNC ID 10780
基因别名 ASF, SF2, SF2p33, SRp30a, MGC52282

基因功能与研究简介

SRSF1(丝氨酸/精氨酸丰富剪接因子1)是SR蛋白家族的重要成员,作为RNA剪接的关键调控因子,参与组成型剪接和可变剪接的调控。SRSF1通过识别外显子剪接增强子(ESE)序列,促进U1 snRNP和U2 snRNP的招募,从而影响剪接位点的选择。此外,SRSF1还参与mRNA的转运、翻译调控和基因组稳定性维持。SRSF1的异常表达与多种肿瘤的发生发展密切相关,包括乳腺癌、肺癌、结直肠癌等,其过表达可促进细胞增殖、抑制凋亡,并影响上皮-间质转化(EMT)。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 SRSF1过表达促进乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭,与不良预后相关。 较强研究证据
肺癌 SRSF1在非小细胞肺癌中高表达,与肿瘤分期和淋巴结转移相关。 较强研究证据
结直肠癌 SRSF1表达上调与结直肠癌的进展和转移相关。 较强研究证据
肝细胞癌 SRSF1过表达促进肝癌细胞增殖和转移,与患者生存率降低相关。 较强研究证据
自身免疫性疾病 SRSF1可能参与调节T细胞功能,与系统性红斑狼疮等自身免疫病相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
暂无明确致病突变 暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无明确证据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致SRSF1蛋白功能丧失或表达下调,可能影响RNA剪接的正常进行,但目前在疾病中证据有限。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:导致SRSF1蛋白功能增强或表达上调,可能促进细胞增殖和肿瘤发生,但具体突变位点尚未明确。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白可能干扰野生型SRSF1的功能,但目前在疾病中证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 mRNA splicing • via spliceosome
• GO:0003729 mRNA binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006397 mRNA processing • GO:0008380 RNA splicing
• GO:0048025 negative regulation of mRNA splicing • via spliceosome

相关通路

hsa03040 Spliceosome
hsa05200 Pathways in cancer

蛋白质功能简介

SRSF1蛋白由494个氨基酸组成,包含两个RNA识别基序(RRM)和一个富含精氨酸/丝氨酸的RS结构域。RRM结构域负责识别RNA序列,RS结构域介导蛋白-蛋白相互作用和亚细胞定位。SRSF1在细胞核内参与剪接体组装,调控mRNA前体的剪接。此外,SRSF1还参与mRNA的核输出和翻译调控。SRSF1的磷酸化状态影响其功能,多种激酶如SRPK1和CLK1可磷酸化SRSF1,调节其活性。

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