SRSF11基因|基因功能、疾病关联、突变与剪接调控研究
SRSF11是RNA剪接调控因子,参与基因表达调控,与多种癌症和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SRSF11 |
|---|---|
| 基因全名 | Serine and Arginine Rich Splicing Factor 11 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p31.1 |
| NCBI Gene ID | 9295 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9295 |
| Ensembl ID | ENSG00000116754 |
| UniProt ID | Q05519 |
| OMIM ID | 602010 |
| HGNC ID | 10785 |
| 基因别名 | SRp54, p54, SRSF11, SFRS11 |
基因功能与研究简介
SRSF11(Serine and Arginine Rich Splicing Factor 11)是SR蛋白家族成员,参与前体mRNA的组成性剪接和选择性剪接调控。该蛋白含有RNA识别基序(RRM)和富含精氨酸/丝氨酸(RS)结构域,通过与其他剪接因子相互作用,影响剪接位点的选择。SRSF11在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,SRSF11参与细胞周期调控、DNA损伤应答和神经元分化等过程,其异常表达与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)和神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | SRSF11在乳腺癌中表达上调,可能通过调控与细胞增殖和凋亡相关基因的剪接促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | SRSF11在非小细胞肺癌中高表达,与不良预后相关,可能通过影响上皮-间质转化(EMT)相关基因的剪接参与肿瘤转移。 | 较强研究证据 |
| 阿尔茨海默病 | SRSF11在阿尔茨海默病患者脑中表达异常,可能通过调控tau蛋白或淀粉样前体蛋白(APP)的剪接影响疾病进程。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | SRSF11在结直肠癌中表达上调,可能通过调控Wnt信号通路相关基因的剪接促进肿瘤发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF-7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.574C>T (p.Arg192Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能异常 |
| c.1021A>G (p.Ser341Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响磷酸化位点,改变剪接活性 |
| c.1234_1235insA (p.Thr412AsnfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
移码突变或提前终止密码子可能导致SRSF11蛋白截短,丧失RNA结合或剪接调控功能,属于功能缺失型突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
某些错义突变可能增强SRSF11的剪接活性或改变其底物特异性,导致异常剪接,属于功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
突变型SRSF11可能干扰野生型蛋白的功能,形成无功能的二聚体,从而抑制正常剪接,属于显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0006397 mRNA processing |
| • GO:0008380 RNA splicing | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0045296 cadherin binding |
相关通路
• hsa03040 Spliceosome
• hsa05169 Epstein-Barr virus infection
蛋白质功能简介
SRSF11蛋白属于SR蛋白家族,包含一个RNA识别基序(RRM)和一个富含精氨酸/丝氨酸(RS)结构域。该蛋白定位于细胞核,参与前体mRNA的剪接调控,通过识别剪接增强子或抑制子序列,影响剪接位点的选择。SRSF11还参与mRNA输出、翻译调控和基因组稳定性维持。其表达水平受细胞周期和应激信号调控,异常表达与肿瘤发生和神经退行性疾病相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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