SRSF6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SRSF6是调控RNA剪接的关键丝氨酸/精氨酸富集剪接因子,其异常表达与多种癌症及遗传病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SRSF6 |
|---|---|
| 基因全名 | Serine and Arginine Rich Splicing Factor 6 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 20q13.11 |
| NCBI Gene ID | 6431 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6431 |
| Ensembl ID | ENSG00000124193 |
| UniProt ID | Q13247 |
| OMIM ID | 601944 |
| HGNC ID | 10786 |
| 基因别名 | B52, SFRS6, SRp55 |
基因功能与研究简介
SRSF6(丝氨酸/精氨酸富集剪接因子6)是SR蛋白家族成员,参与组成性剪接和可变剪接的调控。SRSF6通过结合RNA识别基序,促进剪接体组装,影响基因表达。SRSF6在多种组织中表达,尤其在脑、睾丸和免疫细胞中高表达。SRSF6的异常表达与多种癌症(如乳腺癌、肺癌、结直肠癌)及遗传病(如视网膜色素变性)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 视网膜色素变性 | SRSF6突变导致剪接异常,影响视网膜细胞功能 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | SRSF6过表达促进肿瘤细胞增殖和迁移 | 具有较强研究证据 |
| 肺癌 | SRSF6表达上调与不良预后相关 | 具有较强研究证据 |
| 结直肠癌 | SRSF6异常剪接调控影响肿瘤发生 | 具有较强研究证据 |
| 胶质瘤 | SRSF6高表达与肿瘤恶性程度相关 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 免疫细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.574C>T (p.Arg192Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响RNA结合功能 |
| c.862G>A (p.Gly288Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.1045C>T (p.Arg349Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白功能丧失,影响剪接调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
过表达或某些错义突变可能增强SRSF6活性,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000398 (mRNA splicing | • via spliceosome) |
| • GO:0003723 (RNA binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005681 (spliceosomal complex) |
相关通路
• hsa03040 (Spliceosome)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
SRSF6蛋白属于SR蛋白家族,包含一个RNA识别基序(RRM)和一个富含精氨酸/丝氨酸(RS)结构域。SRSF6在剪接体组装中发挥作用,通过结合pre-mRNA促进剪接。SRSF6还参与mRNA输出、翻译调控等过程。SRSF6的磷酸化状态调节其亚细胞定位和功能。