SS18L2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SS18L2是SS18基因家族成员,参与转录调控和染色质重塑,与神经发育和肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 SS18L2
基因全名 SS18L2, nBAF chromatin remodeling complex subunit
基因类型 protein-coding
染色体位置 3p22.3
NCBI Gene ID 84276 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84276
Ensembl ID ENSG00000163872
UniProt ID Q9UPP2
OMIM ID 614164
HGNC ID 26005
基因别名 DKFZp434B032, FLJ10986, MGC138217

基因功能与研究简介

SS18L2(SS18L2, nBAF chromatin remodeling complex subunit)是SS18基因家族成员,编码的蛋白质是nBAF(neuron-specific BAF)染色质重塑复合物的亚基。该复合物通过ATP依赖的染色质重塑调控基因表达,在神经发育中发挥关键作用。SS18L2可能参与转录调控和DNA修复,其异常表达与多种肿瘤相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SS18L2突变可能影响nBAF复合物功能,导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
肿瘤 SS18L2在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响染色质重塑促进肿瘤发生,但具体作用有待研究。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白质功能
c.456_457del (p.Lys153fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白质截短
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变可能导致nBAF复合物功能受损,影响神经发育。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006338 (chromatin remodeling)
• GO:0003677 (DNA binding)

相关通路

hsa05200 (Pathways in cancer)
hsa05034 (Alcoholism)

蛋白质功能简介

SS18L2蛋白是nBAF染色质重塑复合物的亚基,该复合物通过ATP水解改变染色质结构,调控基因转录。SS18L2在神经系统中高表达,可能参与神经元分化。其异常表达与肿瘤发生相关,但具体机制尚需进一步研究。

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