SSBP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SSBP3编码单链DNA结合蛋白3,参与DNA复制、修复和转录调控,与多种癌症及发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 SSBP3
基因全名 single-stranded DNA binding protein 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p31.1
NCBI Gene ID 23648 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23648
Ensembl ID ENSG00000143190
UniProt ID Q9BWW4
OMIM ID 607231
HGNC ID 11325
基因别名 CSDP, SSDP, SSDP1, FLJ10986

基因功能与研究简介

SSBP3(single-stranded DNA binding protein 3)编码单链DNA结合蛋白,属于SSBP家族。该蛋白在DNA复制、修复、重组和转录调控中发挥重要作用。SSBP3通过与单链DNA结合,参与维持基因组稳定性,并可能调控基因表达。研究表明,SSBP3在多种癌症中表达异常,并与肿瘤发生发展相关。此外,SSBP3在胚胎发育中也有重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SSBP3在多种癌症中表达失调,可能通过影响DNA损伤修复和转录调控促进肿瘤发生。 较强研究证据
发育异常 SSBP3在胚胎发育中表达,可能参与神经管和骨骼发育,但其具体致病机制尚不明确。 潜在关联
暂无明确疾病 目前尚无SSBP3直接致病的单基因遗传病报道。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
MCF7 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456delC (p.Pro152LeufsTer5) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响DNA结合能力。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003697 (single-stranded DNA binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006355 (regulation of transcription • DNA-templated)
• GO:0006281 (DNA repair)

相关通路

hsa03430 (Mismatch repair)
hsa03420 (Nucleotide excision repair)
hsa03410 (Base excision repair)

蛋白质功能简介

SSBP3蛋白属于单链DNA结合蛋白家族,包含一个寡核苷酸/寡糖结合折叠域(OB-fold),能够结合单链DNA。该蛋白在细胞核中表达,参与DNA代谢过程,如复制、修复和重组。SSBP3可能通过与其他蛋白相互作用,调控基因转录。在细胞周期中,SSBP3的表达水平可能发生变化,提示其在细胞增殖中发挥作用。

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