SSBP4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SSBP4编码单链DNA结合蛋白4,参与DNA复制、修复和转录调控,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 SSBP4
基因全名 single stranded DNA binding protein 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.3
NCBI Gene ID 170463 ncbi.nlm.nih.gov/gene/170463
Ensembl ID ENSG00000130589
UniProt ID Q9BQ15
OMIM ID 607982
HGNC ID 11325
基因别名 SOSS-B2, hSSB2, SSBP5

基因功能与研究简介

SSBP4(single stranded DNA binding protein 4)编码单链DNA结合蛋白4,是SOSS(sensor of single-stranded DNA)复合物的组成部分,参与DNA损伤应答、DNA复制和转录调控。SSBP4通过与INTS3和C9ORF80相互作用,稳定SOSS复合物,促进单链DNA的识别和信号传导。研究表明,SSBP4在维持基因组稳定性中发挥重要作用,其功能异常与神经发育障碍和癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SSBP4突变可能导致单链DNA结合功能受损,影响DNA损伤修复,进而影响神经发育。 ClinVar
癌症 SSBP4在DNA损伤应答中的作用提示其可能参与肿瘤发生,但具体证据有限。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(根据GTEx)
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.343C>T (p.Arg115Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.482G>A (p.Arg161Gln) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变导致截短蛋白,可能丧失单链DNA结合能力,影响SOSS复合物功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003697 - single-stranded DNA binding • GO:0005634 - nucleus
• GO:0006281 - DNA repair • GO:0006310 - DNA recombination

相关通路

hsa03430 - Mismatch repair
hsa03420 - Nucleotide excision repair
hsa03410 - Base excision repair

蛋白质功能简介

SSBP4蛋白包含寡核苷酸/寡糖结合折叠(OB-fold)结构域,能够结合单链DNA。作为SOSS复合物的亚基,SSBP4参与DNA损伤应答,促进ATR介导的信号通路。SSBP4在细胞核中表达,与INTS3和C9ORF80相互作用,维持基因组稳定性。

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