SSRP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SSRP1是FACT复合物的核心亚基,参与染色质重塑、DNA损伤修复和转录调控,与多种癌症及发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 SSRP1
基因全名 structure specific recognition protein 1
基因类型 protein coding
染色体位置 11q12.1
NCBI Gene ID 6749 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6749
Ensembl ID ENSG00000149136
UniProt ID Q08945
OMIM ID 604327
HGNC ID 11328
基因别名 FACT80, T160

基因功能与研究简介

SSRP1(structure specific recognition protein 1)编码FACT(facilitates chromatin transcription)复合物的一个亚基,该复合物在染色质重塑中发挥关键作用,参与DNA复制、转录、修复和细胞周期调控。SSRP1通过结合组蛋白H2A-H2B二聚体,促进核小体结构的动态变化,从而影响基因表达和基因组稳定性。研究表明,SSRP1在多种癌症中高表达,与肿瘤发生、发展和预后相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SSRP1在多种癌症中高表达,可能通过促进细胞增殖、抑制凋亡和增强DNA修复能力参与肿瘤发生。 较强研究证据
发育异常 SSRP1功能缺失可能导致胚胎发育异常,但具体机制尚不明确。 潜在关联
暂无明确疾病 暂无可靠数据 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567delC (p.Leu190fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,导致SSRP1蛋白表达减少或功能丧失,可能影响染色质重塑和DNA修复。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,可能增强SSRP1的活性,促进细胞增殖,但具体证据不足。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,可能干扰FACT复合物的正常功能,但尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006338 (chromatin remodeling) • GO:0006281 (DNA repair)
• GO:0006351 (transcription • DNA-templated)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

hsa03030 (DNA replication)
hsa03420 (Nucleotide excision repair)
hsa04110 (Cell cycle)

蛋白质功能简介

SSRP1蛋白是FACT复合物的一个亚基,与SUPT16H形成异二聚体。该复合物通过结合组蛋白H2A-H2B二聚体,促进核小体结构的动态变化,从而在DNA复制、转录和修复过程中调节染色质可及性。SSRP1含有HMG-box结构域,能够识别DNA结构,参与DNA损伤应答。

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