STAMBPL1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
STAMBPL1编码去泛素化酶,参与蛋白质稳态调控,与肿瘤发生和神经发育相关。
基因信息卡
| 基因符号 | STAMBPL1 |
|---|---|
| 基因全名 | STAM binding protein like 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q23.31 |
| NCBI Gene ID | 57559 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57559 |
| Ensembl ID | ENSG00000138175 |
| UniProt ID | Q96F86 |
| OMIM ID | 609255 |
| HGNC ID | 16237 |
| 基因别名 | AMSH-FP, AMSHLP, bA399O19.2 |
基因功能与研究简介
STAMBPL1(STAM binding protein like 1)编码一种去泛素化酶,属于JAMM(JAB1/MPN/Mov34 metalloenzyme)家族。该蛋白与STAM(signal transducing adaptor molecule)结合,参与调控受体信号转导和内体分选。STAMBPL1通过去除底物蛋白上的泛素链,影响蛋白质降解和信号通路活性。研究表明,STAMBPL1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖、凋亡和迁移参与肿瘤发生。此外,STAMBPL1在神经系统中也有表达,可能参与神经发育和突触功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | STAMBPL1在结直肠癌中高表达,可能通过去泛素化稳定β-catenin,激活Wnt信号通路,促进肿瘤细胞增殖和迁移。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | STAMBPL1在肝细胞癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控EGFR信号通路促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | STAMBPL1在乳腺癌中表达升高,可能通过去泛素化稳定ERα,增强雌激素信号,促进肿瘤生长。 | 潜在关联 |
| 神经发育异常 | STAMBPL1在神经系统中表达,可能参与神经元分化,但具体致病机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1000C>T (p.Arg334Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失去泛素化酶活性,功能缺失 |
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或催化活性,功能未知 |
| c.1567G>A (p.Val523Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,丧失去泛素化酶活性,影响底物降解和信号通路。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明STAMBPL1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前尚无明确证据表明STAMBPL1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004843 - thiol-dependent deubiquitinase | • GO:0005737 - cytoplasm |
| • GO:0005829 - cytosol | • GO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process |
| • GO:0016020 - membrane | • GO:0031410 - cytoplasmic vesicle |
相关通路
• hsa04120 - Ubiquitin mediated proteolysis
• hsa04310 - Wnt signaling pathway
• hsa04012 - ErbB signaling pathway
蛋白质功能简介
STAMBPL1蛋白属于JAMM家族去泛素化酶,含有MPN结构域,具有Zn2+依赖的异肽酶活性。它能够去除底物蛋白上的K63和K48连接的泛素链,从而调控蛋白质降解和信号转导。STAMBPL1与STAM结合,参与内体分选复合物(ESCRT)途径,影响受体降解。在细胞中,STAMBPL1主要定位于细胞质和细胞膜,可能通过去泛素化β-catenin、EGFR等底物,调控Wnt和EGFR信号通路。