STIM1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
STIM1是细胞内钙离子稳态的关键调控因子,其突变可导致免疫缺陷、肌病和血栓形成等疾病。
基因信息卡
| 基因符号 | STIM1 |
|---|---|
| 基因全名 | stromal interaction molecule 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11p15.4 |
| NCBI Gene ID | 6786 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6786 |
| Ensembl ID | ENSG00000167323 |
| UniProt ID | Q13586 |
| OMIM ID | 605921 |
| HGNC ID | 11386 |
| 基因别名 | GOK, D11S4896E, IMD10, TAM1, FLJ11631 |
基因功能与研究简介
STIM1(基质相互作用分子1)是内质网(ER)上的单次跨膜蛋白,作为钙离子感受器,在ER钙离子耗竭时通过其EF-hand结构域感知钙浓度变化,发生构象改变并聚集,与质膜上的Orai1通道相互作用,激活钙库操作性钙内流(SOCE),从而调控细胞内钙信号。STIM1在多种细胞功能中发挥关键作用,包括免疫细胞活化、肌肉收缩、血小板活化等。STIM1基因突变可导致多种疾病,如免疫缺陷、肌病和血栓形成等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 免疫缺陷10型 | STIM1功能缺失突变导致SOCE缺陷,影响T细胞和B细胞活化,导致联合免疫缺陷 | ClinVar, OMIM |
| 肌管肌病 | STIM1功能缺失突变影响骨骼肌钙信号,导致肌纤维发育异常 | ClinVar, OMIM |
| Stormorken综合征 | STIM1功能获得性突变导致SOCE过度激活,引起血小板减少、肌病、畏光等 | ClinVar, OMIM |
| 血小板减少 | STIM1功能获得性突变导致血小板钙信号异常,影响血小板生成 | ClinVar, OMIM |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 免疫组织 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Jurkat T细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 血小板 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| p.R429C | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变,导致SOCE过度激活 |
| p.R304W | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变,导致SOCE过度激活 |
| p.E136X | 无义突变 | 罕见 | 功能缺失突变,导致SOCE缺陷 |
| p.L74P | 错义突变 | 罕见 | 功能缺失突变,导致SOCE缺陷 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变导致STIM1蛋白无法正常感知ER钙离子浓度或无法激活Orai1通道,从而损害SOCE,影响免疫细胞活化、肌肉收缩等。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得性突变导致STIM1在静息状态下即激活Orai1通道,引起SOCE过度激活,导致细胞内钙超载,引发血小板减少、肌病等。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明STIM1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005509 calcium ion binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005783 endoplasmic reticulum | • GO:0005886 plasma membrane |
| • GO:0006816 calcium ion transport | • GO:0002115 store-operated calcium entry |
相关通路
• Calcium signaling pathway (KEGG: hsa04020)
• Store-operated calcium entry (Reactome: R-HSA-425986)
蛋白质功能简介
STIM1蛋白由685个氨基酸组成,包含N端EF-hand结构域、SAM结构域、跨膜区、卷曲螺旋结构域和C端富含脯氨酸区域。在静息状态下,STIM1以二聚体形式存在于ER膜上,其EF-hand结构域结合钙离子。当ER钙离子浓度降低时,EF-hand结构域释放钙离子,导致STIM1构象改变并聚集,随后与质膜上的Orai1通道结合,激活SOCE。STIM1在免疫细胞活化、肌肉收缩、血小板活化等过程中发挥关键作用。