STIM1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

STIM1是细胞内钙离子稳态的关键调控因子,其突变可导致免疫缺陷、肌病和血栓形成等疾病。

基因信息卡

基因符号 STIM1
基因全名 stromal interaction molecule 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 11p15.4
NCBI Gene ID 6786 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6786
Ensembl ID ENSG00000167323
UniProt ID Q13586
OMIM ID 605921
HGNC ID 11386
基因别名 GOK, D11S4896E, IMD10, TAM1, FLJ11631

基因功能与研究简介

STIM1(基质相互作用分子1)是内质网(ER)上的单次跨膜蛋白,作为钙离子感受器,在ER钙离子耗竭时通过其EF-hand结构域感知钙浓度变化,发生构象改变并聚集,与质膜上的Orai1通道相互作用,激活钙库操作性钙内流(SOCE),从而调控细胞内钙信号。STIM1在多种细胞功能中发挥关键作用,包括免疫细胞活化、肌肉收缩、血小板活化等。STIM1基因突变可导致多种疾病,如免疫缺陷、肌病和血栓形成等。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
免疫缺陷10型 STIM1功能缺失突变导致SOCE缺陷,影响T细胞和B细胞活化,导致联合免疫缺陷 ClinVar, OMIM
肌管肌病 STIM1功能缺失突变影响骨骼肌钙信号,导致肌纤维发育异常 ClinVar, OMIM
Stormorken综合征 STIM1功能获得性突变导致SOCE过度激活,引起血小板减少、肌病、畏光等 ClinVar, OMIM
血小板减少 STIM1功能获得性突变导致血小板钙信号异常,影响血小板生成 ClinVar, OMIM

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
免疫组织 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Jurkat T细胞 暂无可靠数据 高表达
HEK293 暂无可靠数据 高表达
血小板 暂无可靠数据 高表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
p.R429C 错义突变 罕见 功能获得性突变,导致SOCE过度激活
p.R304W 错义突变 罕见 功能获得性突变,导致SOCE过度激活
p.E136X 无义突变 罕见 功能缺失突变,导致SOCE缺陷
p.L74P 错义突变 罕见 功能缺失突变,导致SOCE缺陷
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变导致STIM1蛋白无法正常感知ER钙离子浓度或无法激活Orai1通道,从而损害SOCE,影响免疫细胞活化、肌肉收缩等。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得性突变导致STIM1在静息状态下即激活Orai1通道,引起SOCE过度激活,导致细胞内钙超载,引发血小板减少、肌病等。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明STIM1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005509 calcium ion binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005783 endoplasmic reticulum • GO:0005886 plasma membrane
• GO:0006816 calcium ion transport • GO:0002115 store-operated calcium entry

相关通路

Calcium signaling pathway (KEGG: hsa04020)
Store-operated calcium entry (Reactome: R-HSA-425986)

蛋白质功能简介

STIM1蛋白由685个氨基酸组成,包含N端EF-hand结构域、SAM结构域、跨膜区、卷曲螺旋结构域和C端富含脯氨酸区域。在静息状态下,STIM1以二聚体形式存在于ER膜上,其EF-hand结构域结合钙离子。当ER钙离子浓度降低时,EF-hand结构域释放钙离子,导致STIM1构象改变并聚集,随后与质膜上的Orai1通道结合,激活SOCE。STIM1在免疫细胞活化、肌肉收缩、血小板活化等过程中发挥关键作用。

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