STIM2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
STIM2是细胞内钙信号调控的关键分子,参与免疫、神经及肌肉功能,其异常与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | STIM2 |
|---|---|
| 基因全名 | stromal interaction molecule 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4p15.1 |
| NCBI Gene ID | 57620 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57620 |
| Ensembl ID | ENSG00000165029 |
| UniProt ID | Q9P246 |
| OMIM ID | 610841 |
| HGNC ID | 16987 |
| 基因别名 | KIAA1482, FLJ11730 |
基因功能与研究简介
STIM2(基质相互作用分子2)是内质网上的钙离子传感器,与STIM1同源。在静息状态下,STIM2与内质网腔内的钙离子结合;当内质网钙离子耗竭时,STIM2发生构象变化并易位至质膜,激活Orai通道,介导钙库操控的钙内流(SOCE)。STIM2对维持细胞内钙稳态和基础钙水平至关重要,参与T细胞活化、神经元信号传导、肌肉收缩等过程。STIM2功能异常与免疫缺陷、神经退行性疾病和癌症等密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 免疫缺陷 | STIM2功能缺失导致SOCE受损,影响T细胞活化和细胞因子产生,可能引起原发性免疫缺陷。 | ClinVar, OMIM |
| 神经退行性疾病 | STIM2表达异常影响神经元钙稳态,与阿尔茨海默病等神经退行性疾病相关。 | PubMed |
| 癌症 | STIM2在多种肿瘤中表达异常,影响肿瘤细胞增殖、迁移和凋亡,但具体机制尚在研究中。 | COSMIC, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Jurkat T细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1210C>T (p.Arg404Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1663G>A (p.Gly555Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.2002C>T (p.Arg668Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,导致STIM2蛋白功能丧失或减弱,影响SOCE通路,可能引起免疫缺陷等疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,目前暂无明确证据表明STIM2存在此类突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变,目前暂无明确证据表明STIM2存在此类突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005509 calcium ion binding | • GO:0005783 endoplasmic reticulum |
| • GO:0005886 plasma membrane | • GO:0006816 calcium ion transport |
| • GO:0002115 store-operated calcium entry |
相关通路
• hsa04660 T cell receptor signaling pathway
• hsa04020 Calcium signaling pathway
蛋白质功能简介
STIM2蛋白由746个氨基酸组成,包含N端EF-hand结构域、SAM结构域、跨膜结构域和C端卷曲螺旋结构域。EF-hand结构域负责感知内质网腔内的钙离子浓度,当钙离子浓度降低时,STIM2发生构象变化,通过SAM结构域形成寡聚体,并易位至质膜,与Orai通道相互作用,激活SOCE。STIM2在维持基础钙水平中起重要作用,其功能与STIM1部分重叠但又有差异。