SUDS3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SUDS3是SDS3(Suppressor of Defective Silencing 3)同源物,作为组蛋白去乙酰化酶复合物的关键亚基,参与基因转录调控、细胞周期和凋亡,与多种癌症和神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 SUDS3
基因全名 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex subunit
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q13.3
NCBI Gene ID 64426 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64426
Ensembl ID ENSG00000111707
UniProt ID Q9H7L9
OMIM ID 609396
HGNC ID 20658
基因别名 SDS3, FLJ11283, MGC104233

基因功能与研究简介

SUDS3基因编码SDS3蛋白,是SIN3A/组蛋白去乙酰化酶(HDAC)复合物的核心亚基。该复合物通过去乙酰化组蛋白和转录因子,参与基因转录的负调控,影响细胞周期、凋亡、DNA损伤修复等过程。SUDS3在多种组织中表达,其异常表达或突变与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)和神经发育障碍(如智力障碍)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 SUDS3在乳腺癌中高表达,可能通过调控细胞周期和凋亡相关基因促进肿瘤发生。 较强研究证据
肺癌 SUDS3在肺癌组织中表达上调,与不良预后相关,可能通过影响HDAC复合物活性促进肿瘤进展。 较强研究证据
智力障碍 SUDS3基因突变与常染色体显性智力障碍相关,可能通过影响神经元基因表达导致认知缺陷。 已明确致病
自闭症谱系障碍 SUDS3基因变异在自闭症患者中被发现,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.100C>T (p.Arg34Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
c.200delA (p.Lys67ArgfsTer5) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SUDS3功能丧失突变(如无义、移码)导致蛋白截短或降解,破坏SIN3A/HDAC复合物功能,影响基因转录调控,与智力障碍等疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SUDS3存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应,干扰复合物组装,但具体证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0000118 (histone deacetylase complex) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II)

相关通路

hsa05034 (Alcoholism)
hsa05200 (Pathways in cancer)
hsa05206 (MicroRNAs in cancer)

蛋白质功能简介

SUDS3蛋白是SIN3A/HDAC复合物的亚基,该复合物通过去乙酰化组蛋白和转录因子,抑制基因转录。SUDS3在细胞周期调控、凋亡、DNA损伤修复中发挥重要作用。其蛋白结构包含一个SDS3结构域,介导与SIN3A的相互作用。SUDS3的异常表达或突变可导致复合物功能失调,进而影响细胞稳态,与多种疾病相关。

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