SUGP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SUGP1编码剪接因子,参与RNA剪接调控,与癌症和发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 SUGP1
基因全名 SURP and G-patch domain containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.11
NCBI Gene ID 57794 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57794
Ensembl ID ENSG00000105607
UniProt ID Q8IYB3
OMIM ID 607542
HGNC ID 24970
基因别名 SURP1, GPATCH9, SUGP1

基因功能与研究简介

SUGP1基因编码一种含有SURP和G-patch结构域的蛋白质,参与RNA剪接调控。该蛋白可能作为剪接因子,影响前体mRNA的加工过程。研究表明SUGP1在多种组织中表达,其功能异常与癌症和发育异常相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SUGP1突变可能影响RNA剪接,导致基因表达异常,促进肿瘤发生。 较强研究证据
发育异常 SUGP1在胚胎发育中表达,可能参与器官形成,突变可能导致发育缺陷。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
c.456C>T (p.Arg152Ter) 无义突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变导致蛋白截短,可能影响剪接调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0006397 mRNA processing
• GO:0008380 RNA splicing • GO:0005634 nucleus

相关通路

hsa03040 Spliceosome

蛋白质功能简介

SUGP1蛋白含有SURP和G-patch结构域,可能参与RNA剪接。其具体功能尚不完全清楚,但研究表明它可能作为剪接因子,调控基因表达。

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