SUGP2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SUGP2(SURP and G-patch domain containing 2)是一种RNA结合蛋白,参与RNA剪接调控,与多种癌症和遗传性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SUGP2 |
|---|---|
| 基因全名 | SURP and G-patch domain containing 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19p13.11 |
| NCBI Gene ID | 10146 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10146 |
| Ensembl ID | ENSG00000104884 |
| UniProt ID | Q8IX01 |
| OMIM ID | 607493 |
| HGNC ID | 17062 |
| 基因别名 | SFRS2B, SRrp130, FLJ10377 |
基因功能与研究简介
SUGP2(SURP and G-patch domain containing 2)是一种RNA结合蛋白,属于剪接因子家族。它含有SURP结构域和G-patch结构域,参与前体mRNA的剪接调控,影响基因表达。SUGP2在多种组织中表达,尤其在睾丸和脑中高表达。研究表明,SUGP2与多种癌症(如肺癌、乳腺癌)和遗传性疾病相关,可能通过调控RNA剪接影响细胞增殖、凋亡和分化。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | SUGP2在多种癌症中表达异常,可能通过调控RNA剪接影响肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 遗传性疾病 | 暂无明确证据表明SUGP2直接导致遗传性疾病。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.456C>T (p.Pro152Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变可能导致SUGP2蛋白活性降低,影响RNA剪接调控,进而导致疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得突变可能增强SUGP2的活性,导致异常剪接,与癌症相关。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能干扰正常SUGP2功能,影响剪接过程。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0006397 mRNA processing |
| • GO:0008380 RNA splicing | • GO:0005634 nucleus |
相关通路
• Pathway: mRNA Splicing - Major Pathway (Reactome: R-HSA-72163)
• Pathway: Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA (Reactome: R-HSA-72203)
蛋白质功能简介
SUGP2蛋白包含SURP结构域和G-patch结构域,属于RNA结合蛋白。它参与前体mRNA的剪接调控,可能通过与剪接体组分相互作用影响剪接位点选择。SUGP2在多种组织中表达,尤其在睾丸和脑中高表达。研究表明,SUGP2可能通过调控RNA剪接影响细胞增殖、凋亡和分化,与多种癌症相关。