SUMF1基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SUMF1基因编码甲酰甘氨酸生成酶,是硫酸酯酶家族修饰的关键酶,其突变导致多种硫酸酯酶缺乏症。
基因信息卡
| 基因符号 | SUMF1 |
|---|---|
| 基因全名 | Sulfatase Modifying Factor 1 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 3p26.1 |
| NCBI Gene ID | 285362 ncbi.nlm.nih.gov/gene/285362 |
| Ensembl ID | ENSG00000144455 |
| UniProt ID | Q8NBK3 |
| OMIM ID | 607939 |
| HGNC ID | 20376 |
| 基因别名 | FGE, MSD, UNQ3037/PRO9857 |
基因功能与研究简介
SUMF1基因编码甲酰甘氨酸生成酶(FGE),该酶在内质网中催化硫酸酯酶活性位点半胱氨酸残基氧化为甲酰甘氨酸(FGly),是硫酸酯酶家族翻译后修饰的关键步骤。硫酸酯酶参与多种底物的分解代谢,包括糖胺聚糖、硫脂和类固醇硫酸酯。SUMF1基因突变导致多发性硫酸酯酶缺乏症(MSD),这是一种罕见的常染色体隐性遗传病,表现为所有硫酸酯酶活性降低,导致多种底物在溶酶体中累积,影响多个器官系统。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 多发性硫酸酯酶缺乏症(MSD) | SUMF1基因突变导致FGE酶活性丧失或降低,无法对硫酸酯酶进行FGly修饰,进而使所有硫酸酯酶活性降低或缺失,导致多种底物(如糖胺聚糖、硫脂等)在溶酶体中累积,引发多系统病变。 | 已明确致病(OMIM #272200) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.739G>A (p.Gly247Ser) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 导致FGE酶活性降低,影响硫酸酯酶修饰 |
| c.836A>G (p.Asn279Ser) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 导致FGE酶活性降低,影响硫酸酯酶修饰 |
| c.103C>T (p.Arg35Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 导致FGE蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数SUMF1突变导致FGE酶活性丧失或降低,属于功能缺失型突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SUMF1存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SUMF1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003824 (催化活性) | • GO:0005783 (内质网) |
| • GO:0005794 (高尔基体) | • GO:0006629 (脂质代谢过程) |
| • GO:0008152 (代谢过程) | • GO:0016491 (氧化还原酶活性) |
相关通路
• 硫酸酯酶修饰(Sulfatase modification)
• 溶酶体(Lysosome)
蛋白质功能简介
SUMF1编码的甲酰甘氨酸生成酶(FGE)是一种内质网驻留蛋白,属于硫酸酯酶修饰因子家族。FGE通过氧化硫酸酯酶活性位点的半胱氨酸残基为甲酰甘氨酸(FGly),这一修饰是硫酸酯酶催化活性所必需的。FGE缺陷导致所有硫酸酯酶活性丧失,引发多发性硫酸酯酶缺乏症。