SUPT4H1基因|基因功能、疾病关联、突变与转录调控研究

SUPT4H1编码转录延伸因子复合物亚基,参与RNA聚合酶II转录延伸及DNA损伤应答,与神经发育和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SUPT4H1
基因全名 SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q22
NCBI Gene ID 6829 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6829
Ensembl ID ENSG00000141480
UniProt ID P63272
OMIM ID 603555
HGNC ID 11465
基因别名 SPT4, SPT4H, Supt4h1

基因功能与研究简介

SUPT4H1基因编码DSIF(DRB sensitivity-inducing factor)复合物的一个亚基,该复合物由SUPT4H1和SUPT5H组成,在RNA聚合酶II转录延伸过程中起关键作用。SUPT4H1参与调控转录延伸、mRNA加工以及DNA损伤应答。研究表明,SUPT4H1在神经发育中具有重要作用,其突变可能导致神经发育障碍。此外,SUPT4H1在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤发生和发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SUPT4H1突变可能影响转录延伸,导致神经发育异常,但具体机制尚在研究中。 ClinVar中有致病性变异报道,但证据等级不一。
癌症 SUPT4H1在多种肿瘤中表达上调,可能通过调控转录延伸影响癌基因表达,但直接致病证据有限。 COSMIC数据库记录有体细胞突变,但频率较低。

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失。
c.352C>T (p.Arg118Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,可能丧失功能。
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变或移码突变,导致蛋白功能缺失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006351 (transcription
• DNA-templated) • GO:0006368 (transcription elongation from RNA polymerase II promoter)
• GO:0008023 (transcription elongation factor complex)

相关通路

hsa03022 (Basal transcription factors)
hsa03040 (Spliceosome)

蛋白质功能简介

SUPT4H1蛋白是DSIF复合物的亚基,与SUPT5H形成异二聚体,结合RNA聚合酶II并调控转录延伸。该蛋白在细胞核中广泛表达,参与转录延伸、mRNA加工和DNA损伤应答。SUPT4H1的异常表达或突变可能影响基因表达调控,与神经发育和癌症相关。

相关产品

产品名称 货号 物种 基因 ID
联系我们
*
*
*
来源:
service online

  • 留言
  • You can send email to contact us.
    邮箱
  • You can send email to contact us.
    电话
    联系电话
    中国总部
    18102225074(微信同号)

  •  回到顶部