SUPT6H基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SUPT6H是转录延伸和染色质重塑的关键因子,其突变与神经发育障碍和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SUPT6H
基因全名 SPT6 homolog, histone chaperone and transcription elongation factor
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 17q11.2
NCBI Gene ID 6830 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6830
Ensembl ID ENSG00000109111
UniProt ID Q7KZ85
OMIM ID 601333
HGNC ID 11470
基因别名 SPT6, SPT6H, KIAA0162

基因功能与研究简介

SUPT6H基因编码SPT6蛋白,是转录延伸和染色质重塑的关键因子。SPT6作为组蛋白伴侣,参与RNA聚合酶II的转录延伸过程,并调控染色质结构。该基因在多种细胞过程中发挥重要作用,包括基因表达调控、DNA修复和细胞周期。SUPT6H的突变与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SUPT6H突变可能导致转录调控异常,影响神经发育,但具体机制尚在研究中。 ClinVar中有致病性变异记录,但证据等级不一。
癌症 SUPT6H在多种癌症中表达异常,可能通过影响基因表达调控参与肿瘤发生。 COSMIC数据库中有体细胞突变记录,但功能影响尚不明确。

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知。
c.2345delC (p.Pro782LeufsTer3) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失。
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响转录延伸功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006351 (transcription
• DNA-templated) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:0031490 (chromatin DNA binding)
• GO:0042393 (histone binding)

相关通路

hsa03022 (Basal transcription factors)
hsa03040 (Spliceosome)

蛋白质功能简介

SPT6蛋白是转录延伸因子,与RNA聚合酶II相互作用,参与染色质重塑和组蛋白修饰。它包含一个SH2结构域和一个酸性区域,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。SPT6在基因表达调控中起关键作用,其功能异常可能导致多种疾病。

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