SVIP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SVIP(小VCP/p97互作蛋白)是内质网相关降解(ERAD)和自噬调控的关键因子,参与多种细胞应激反应,与神经退行性疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SVIP
基因全名 small VCP/p97-interacting protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p36.33
NCBI Gene ID 258010 ncbi.nlm.nih.gov/gene/258010
Ensembl ID ENSG00000162692
UniProt ID Q8NHG7
OMIM ID 611568
HGNC ID 28312
基因别名 DKFZp761E198, FLJ12806

基因功能与研究简介

SVIP(small VCP/p97-interacting protein)基因编码一种小分子蛋白,是内质网相关降解(ERAD)途径的关键调控因子。SVIP通过与VCP/p97相互作用,调节ERAD底物的降解,并参与自噬过程。SVIP在多种组织中表达,尤其在骨骼肌和心脏中高表达。研究表明,SVIP在神经退行性疾病、癌症和肌肉萎缩中发挥重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SVIP在多种癌症中表达异常,可能通过调控ERAD和自噬影响肿瘤发生发展。 具有较强研究证据
神经退行性疾病 SVIP参与调控错误折叠蛋白的清除,其功能异常可能与神经退行性疾病相关。 潜在关联
肌肉萎缩 SVIP在骨骼肌中高表达,可能参与肌肉蛋白稳态的调控。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
C2C12 暂无可靠数据 肌肉细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.100C>T (p.Arg34Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白结构,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,可能导致SVIP蛋白表达减少或功能缺失,影响ERAD和自噬过程。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005783 endoplasmic reticulum • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process
• GO:0006914 autophagy

相关通路

Endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) pathway
Autophagy pathway

蛋白质功能简介

SVIP蛋白由106个氨基酸组成,包含一个VCP/p97结合域和一个跨膜域。SVIP通过其VCP结合域与VCP/p97相互作用,促进ERAD底物的降解。此外,SVIP还参与自噬的调控,通过影响自噬体形成和溶酶体融合。SVIP在细胞应激条件下表达上调,有助于清除错误折叠蛋白,维持细胞稳态。

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