SWSAP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SWSAP1是参与DNA损伤修复和同源重组的关键蛋白,其功能异常与基因组不稳定性和肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SWSAP1 |
|---|---|
| 基因全名 | SWIM-type zinc finger 7 associated protein 1 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 19p13.3 |
| NCBI Gene ID | 374918 ncbi.nlm.nih.gov/gene/374918 |
| Ensembl ID | ENSG00000188313 |
| UniProt ID | Q5T6F2 |
| OMIM ID | 617258 |
| HGNC ID | 26463 |
| 基因别名 | C19orf39, FLJ32921 |
基因功能与研究简介
SWSAP1(SWIM-type zinc finger 7 associated protein 1)基因编码一种参与DNA损伤修复和同源重组(HR)的蛋白。该蛋白与SWI5(SWIM-type zinc finger 7)相互作用,形成复合物,在DNA双链断裂修复中发挥重要作用。SWSAP1通过促进RAD51介导的同源重组,维持基因组稳定性。研究表明,SWSAP1功能异常可能导致DNA修复缺陷,增加肿瘤发生风险。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | SWSAP1表达异常可能影响DNA修复,增加乳腺癌风险。 | 具有较强研究证据 |
| 卵巢癌 | SWSAP1在卵巢癌中表达下调,可能参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | SWSAP1突变或表达异常与结直肠癌风险相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.394C>T (p.Arg132Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.497A>G (p.Glu166Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致蛋白功能丧失,影响DNA修复。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0006281 (DNA repair) |
| • GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination) |
相关通路
• Homologous recombination repair (Reactome: R-HSA-5693538)
• DNA double-strand break repair (KEGG: hsa03440)
蛋白质功能简介
SWSAP1蛋白包含一个SWIM-type锌指结构域,与SWI5蛋白相互作用,参与DNA损伤应答。该蛋白在细胞核中定位,与RAD51共定位于DNA损伤位点,促进同源重组修复。SWSAP1的缺失会导致细胞对DNA损伤剂敏感,并增加基因组不稳定性。