SWSAP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SWSAP1是参与DNA损伤修复和同源重组的关键蛋白,其功能异常与基因组不稳定性和肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 SWSAP1
基因全名 SWIM-type zinc finger 7 associated protein 1
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 19p13.3
NCBI Gene ID 374918 ncbi.nlm.nih.gov/gene/374918
Ensembl ID ENSG00000188313
UniProt ID Q5T6F2
OMIM ID 617258
HGNC ID 26463
基因别名 C19orf39, FLJ32921

基因功能与研究简介

SWSAP1(SWIM-type zinc finger 7 associated protein 1)基因编码一种参与DNA损伤修复和同源重组(HR)的蛋白。该蛋白与SWI5(SWIM-type zinc finger 7)相互作用,形成复合物,在DNA双链断裂修复中发挥重要作用。SWSAP1通过促进RAD51介导的同源重组,维持基因组稳定性。研究表明,SWSAP1功能异常可能导致DNA修复缺陷,增加肿瘤发生风险。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 SWSAP1表达异常可能影响DNA修复,增加乳腺癌风险。 具有较强研究证据
卵巢癌 SWSAP1在卵巢癌中表达下调,可能参与肿瘤发生。 潜在关联
结直肠癌 SWSAP1突变或表达异常与结直肠癌风险相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
胸腺 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.394C>T (p.Arg132Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.497A>G (p.Glu166Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致蛋白功能丧失,影响DNA修复。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0006281 (DNA repair)
• GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination)

相关通路

Homologous recombination repair (Reactome: R-HSA-5693538)
DNA double-strand break repair (KEGG: hsa03440)

蛋白质功能简介

SWSAP1蛋白包含一个SWIM-type锌指结构域,与SWI5蛋白相互作用,参与DNA损伤应答。该蛋白在细胞核中定位,与RAD51共定位于DNA损伤位点,促进同源重组修复。SWSAP1的缺失会导致细胞对DNA损伤剂敏感,并增加基因组不稳定性。

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