SWT1基因|RNA降解调控、疾病关联与突变研究
SWT1是RNA外泌体相关核酸内切酶,参与RNA加工与降解,其功能异常可能与神经发育和肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SWT1 |
|---|---|
| 基因全名 | SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q25.3 |
| NCBI Gene ID | 55023 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55023 |
| Ensembl ID | ENSG00000143157 |
| UniProt ID | Q9H0I2 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:28757 |
| 基因别名 | C1orf34, FLJ12606 |
基因功能与研究简介
SWT1基因编码一种RNA内切酶,在酵母中参与RNA加工和降解过程,人类同源物可能具有类似功能。研究表明SWT1可能参与mRNA质量控制、rRNA加工等过程,但其具体功能仍需进一步研究。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 暂无明确疾病关联 | 暂无明确证据 | 暂无可靠数据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 暂无明确致病突变 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无明确证据 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004519 (endonuclease activity) | • GO:0006396 (RNA processing) |
| • GO:0005634 (nucleus) |
相关通路
• RNA degradation (KEGG: hsa03018)
蛋白质功能简介
SWT1蛋白属于RNA内切酶家族,含有C3H1型锌指结构域,可能参与RNA的切割和降解。在酵母中,Swt1p与核孔复合体相关,参与mRNA质量控制。人类SWT1可能具有类似功能,但具体底物和机制尚待阐明。