TAF11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TAF11是转录因子IID复合物的核心亚基,参与RNA聚合酶II启动转录,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TAF11 |
|---|---|
| 基因全名 | TATA-box binding protein associated factor 11 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6p21.31 |
| NCBI Gene ID | 6882 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6882 |
| Ensembl ID | ENSG00000112294 |
| UniProt ID | Q15544 |
| OMIM ID | 600772 |
| HGNC ID | 11544 |
| 基因别名 | TAF2I, TAFII28, MGC:150548 |
基因功能与研究简介
TAF11(TATA-box binding protein associated factor 11)是转录因子IID(TFIID)复合物的一个亚基,该复合物在RNA聚合酶II介导的转录起始中起关键作用。TAF11与其他TAF蛋白及TATA结合蛋白(TBP)结合,形成TFIID复合物,识别核心启动子并招募转录机器。TAF11在细胞增殖、分化和发育中发挥重要作用。研究表明,TAF11的突变与神经发育障碍(如智力障碍和自闭症谱系障碍)相关。此外,TAF11在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 智力障碍 | TAF11基因突变导致蛋白功能异常,影响转录调控,进而影响神经发育。 | ClinVar, OMIM |
| 自闭症谱系障碍 | 部分自闭症患者携带TAF11罕见变异,可能通过影响基因表达网络导致疾病。 | ClinVar, 文献 |
| 癌症 | TAF11在多种肿瘤中表达上调或下调,可能通过调控细胞增殖相关基因影响肿瘤发生发展。 | COSMIC, 文献 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据GTEx) |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.424C>T (p.Arg142Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
| c.617G>A (p.Arg206His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构或功能 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 罕见 | 可能影响翻译起始 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变、移码突变等导致蛋白功能丧失,与神经发育障碍相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0006367 transcription initiation at RNA polymerase II promoter | • GO:0005669 transcription factor TFIID complex |
相关通路
• hsa03022 Basal transcription factors
• hsa04120 Ubiquitin mediated proteolysis (间接相关)
蛋白质功能简介
TAF11蛋白由211个氨基酸组成,分子量约24 kDa。它包含一个保守的TAF11结构域,参与蛋白相互作用。TAF11是TFIID复合物的核心组分,与TAF1、TAF2等亚基相互作用,稳定复合物结构。TAF11还参与DNA结合和启动子识别,对转录起始至关重要。
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