TAF13基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TAF13是转录因子IID复合物的核心亚基,参与RNA聚合酶II启动转录,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 TAF13
基因全名 TATA-box binding protein associated factor 13
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p13.3
NCBI Gene ID 6884 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6884
Ensembl ID ENSG00000197780
UniProt ID Q15542
OMIM ID 600774
HGNC ID 11546
基因别名 TAFII18, TAF2K, MGC:150550

基因功能与研究简介

TAF13(TATA-box binding protein associated factor 13)是转录因子IID(TFIID)复合物的一个亚基,该复合物在RNA聚合酶II介导的转录起始中起关键作用。TAF13与其他TAF蛋白及TATA结合蛋白(TBP)共同组装成TFIID,参与启动子识别和转录预起始复合物的形成。TAF13在细胞增殖、分化和发育中具有重要功能。研究表明,TAF13的突变与常染色体隐性遗传的智力障碍和神经发育障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
常染色体隐性遗传智力障碍 TAF13基因纯合或复合杂合突变导致蛋白功能丧失,影响TFIID复合物组装,进而干扰基因转录,导致神经发育异常。 ClinVar, OMIM
神经发育障碍 TAF13突变与智力障碍、发育迟缓、语言障碍等表型相关,证据来自多个家系研究。 OMIM, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(根据GTEx,但nTPM未提供)
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
其他组织 暂无可靠数据 广泛表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1?) 错义/起始密码子突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.2T>C (p.Met1?) 错义/起始密码子突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.3G>A (p.Met1?) 错义/起始密码子突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

TAF13突变导致蛋白功能丧失,影响TFIID复合物组装和转录活性,是疾病的主要机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明TAF13突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明TAF13突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0006351 transcription • DNA-templated
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0005669 transcription factor TFIID complex • GO:0005634 nucleus

相关通路

hsa03022 Basal transcription factors
R-HSA-109582 Hemostasis
R-HSA-74160 Gene expression (Transcription)

蛋白质功能简介

TAF13蛋白是TFIID复合物的亚基之一,分子量约为18 kDa。它包含一个组蛋白折叠结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用,有助于TFIID复合物的组装和稳定性。TAF13在转录起始中协助TBP结合启动子,并与其他TAF蛋白协同调节基因表达。

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