TAF13基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TAF13是转录因子IID复合物的核心亚基,参与RNA聚合酶II启动转录,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TAF13 |
|---|---|
| 基因全名 | TATA-box binding protein associated factor 13 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p13.3 |
| NCBI Gene ID | 6884 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6884 |
| Ensembl ID | ENSG00000197780 |
| UniProt ID | Q15542 |
| OMIM ID | 600774 |
| HGNC ID | 11546 |
| 基因别名 | TAFII18, TAF2K, MGC:150550 |
基因功能与研究简介
TAF13(TATA-box binding protein associated factor 13)是转录因子IID(TFIID)复合物的一个亚基,该复合物在RNA聚合酶II介导的转录起始中起关键作用。TAF13与其他TAF蛋白及TATA结合蛋白(TBP)共同组装成TFIID,参与启动子识别和转录预起始复合物的形成。TAF13在细胞增殖、分化和发育中具有重要功能。研究表明,TAF13的突变与常染色体隐性遗传的智力障碍和神经发育障碍相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体隐性遗传智力障碍 | TAF13基因纯合或复合杂合突变导致蛋白功能丧失,影响TFIID复合物组装,进而干扰基因转录,导致神经发育异常。 | ClinVar, OMIM |
| 神经发育障碍 | TAF13突变与智力障碍、发育迟缓、语言障碍等表型相关,证据来自多个家系研究。 | OMIM, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据GTEx,但nTPM未提供) |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 广泛表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1?) | 错义/起始密码子突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.2T>C (p.Met1?) | 错义/起始密码子突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.3G>A (p.Met1?) | 错义/起始密码子突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
TAF13突变导致蛋白功能丧失,影响TFIID复合物组装和转录活性,是疾病的主要机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明TAF13突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TAF13突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0006351 transcription | • DNA-templated |
| • GO:0006355 regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0005669 transcription factor TFIID complex | • GO:0005634 nucleus |
相关通路
• hsa03022 Basal transcription factors
• R-HSA-109582 Hemostasis
• R-HSA-74160 Gene expression (Transcription)
蛋白质功能简介
TAF13蛋白是TFIID复合物的亚基之一,分子量约为18 kDa。它包含一个组蛋白折叠结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用,有助于TFIID复合物的组装和稳定性。TAF13在转录起始中协助TBP结合启动子,并与其他TAF蛋白协同调节基因表达。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|