TAF1D基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TAF1D是RNA聚合酶I转录因子复合物的关键组分,调控核糖体RNA合成,与癌症和发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 TAF1D
基因全名 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit D
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q21
NCBI Gene ID 79101 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79101
Ensembl ID ENSG00000166004
UniProt ID Q9HBM1
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID 25856
基因别名 TAF1C, TAFI95, TAFI48

基因功能与研究简介

TAF1D基因编码TATA盒结合蛋白相关因子,是RNA聚合酶I转录因子复合物SL1的亚基之一。该复合物负责启动核糖体RNA(rRNA)基因的转录,对核糖体生物发生和细胞生长至关重要。TAF1D通过与TAF1A、TAF1B等亚基相互作用,参与rRNA启动子的识别和转录起始。研究表明,TAF1D在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤细胞的增殖和存活。此外,TAF1D的突变或表达失调与某些发育异常相关,但具体机制尚需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 TAF1D在多种癌症中表达上调,可能通过促进rRNA合成和核糖体生物发生来支持肿瘤细胞的高增殖需求。 较强研究证据
发育异常 TAF1D突变可能导致核糖体生物发生障碍,影响胚胎发育,但具体表型尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
甲状腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白结构,但功能影响未知
c.567delC (p.Leu190TrpfsTer5) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能破坏SL1复合物功能,影响rRNA转录。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000993 • GO:0005665
• GO:0006361

相关通路

hsa03020
hsa04151

蛋白质功能简介

TAF1D蛋白是RNA聚合酶I转录因子复合物SL1的亚基,分子量约95 kDa。该蛋白包含多个WD40重复结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用。TAF1D与TAF1A、TAF1B等亚基形成复合物,识别rRNA启动子并招募RNA聚合酶I,从而启动rRNA基因的转录。TAF1D的表达水平与细胞增殖状态密切相关,在快速增殖的细胞中表达较高。

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