TAF1L基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TAF1L是转录因子TFIID复合物的一个亚基,在基因表达调控中发挥重要作用,其突变可能与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TAF1L |
|---|---|
| 基因全名 | TATA-box binding protein associated factor 1 like |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9p21.3 |
| NCBI Gene ID | 138474 ncbi.nlm.nih.gov/gene/138474 |
| Ensembl ID | ENSG00000136813 |
| UniProt ID | Q8IZX4 |
| OMIM ID | 313650 |
| HGNC ID | 11539 |
| 基因别名 | TAF1L, TAFII-170, TAF2A2 |
基因功能与研究简介
TAF1L(TATA-box binding protein associated factor 1 like)是转录因子TFIID复合物的一个亚基,参与RNA聚合酶II介导的转录起始。TAF1L与TAF1具有高度同源性,但在表达模式上有所不同,主要在睾丸和脑中表达。TAF1L可能参与细胞周期调控和神经发育,其突变与X连锁智力障碍相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| X连锁智力障碍 | TAF1L突变可能导致蛋白功能丧失,影响转录调控,进而影响神经发育。 | OMIM |
| 癌症 | TAF1L在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.346C>T (p.Arg116*) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能为Loss of Function |
| c.1180A>G (p.Thr394Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变导致蛋白截短,可能引起单倍剂量不足或显性负效应。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明TAF1L存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分错义突变可能产生显性负效应,干扰正常TAF1L功能,但需进一步验证。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006367 transcription initiation at RNA polymerase II promoter | • GO:0005669 transcription factor TFIID complex |
相关通路
• hsa03022 Basal transcription factors
蛋白质功能简介
TAF1L蛋白是TFIID复合物的一个亚基,包含一个N端的TAF1同源区域和一个C端的溴结构域,可能参与染色质重塑和转录激活。TAF1L在睾丸和脑中高表达,可能参与精子发生和神经发育。