TAF9基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TAF9是转录因子TFIID复合物的关键亚基,参与RNA聚合酶II介导的转录起始,其功能异常与多种疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TAF9 |
|---|---|
| 基因全名 | TATA-box binding protein associated factor 9 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q13.2 |
| NCBI Gene ID | 6880 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6880 |
| Ensembl ID | ENSG00000163823 |
| UniProt ID | Q16594 |
| OMIM ID | 600822 |
| HGNC ID | 11542 |
| 基因别名 | TAFII31, TAF2G, TAFII-31, MGC:1604 |
基因功能与研究简介
TAF9(TATA-box binding protein associated factor 9)是转录因子TFIID复合物的一个亚基,该复合物在RNA聚合酶II介导的转录起始中起关键作用。TAF9通过其组蛋白折叠结构域与TFIID复合物的其他亚基相互作用,参与启动子识别和转录激活。TAF9在多种组织中表达,对细胞生长和分化至关重要。研究表明,TAF9的异常表达或突变可能与某些癌症和发育障碍相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | TAF9在多种癌症中表达异常,可能通过影响转录调控促进肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 发育障碍 | TAF9基因突变可能导致发育异常,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能丧失 |
| c.100C>T (p.Arg34Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白质结构,导致功能异常 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致TAF9蛋白活性降低或缺失,可能影响转录调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0006367 transcription initiation at RNA polymerase II promoter | • GO:0005669 transcription factor TFIID complex |
相关通路
• hsa03022 Basal transcription factors
• hsa04120 Ubiquitin mediated proteolysis
蛋白质功能简介
TAF9蛋白是TFIID复合物的一个亚基,包含一个组蛋白折叠结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用。该蛋白在转录起始中发挥重要作用,可能通过与其他转录因子协同作用调控基因表达。TAF9的异常表达或突变可能影响细胞增殖和分化,与肿瘤发生相关。
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