TARBP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TARBP1编码TAR(HIV-1)RNA结合蛋白1,参与RNA代谢和基因调控,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 TARBP1
基因全名 TAR (HIV-1) RNA binding protein 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q42.2
NCBI Gene ID 6894 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6894
Ensembl ID ENSG00000143178
UniProt ID Q13395
OMIM ID 605050
HGNC ID 11568
基因别名 TRBP1, TRBP, TARBP1

基因功能与研究简介

TARBP1基因编码TAR(HIV-1)RNA结合蛋白1,该蛋白含有双链RNA结合域,参与RNA代谢、基因沉默和信号转导。TARBP1在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明TARBP1与HIV-1 Tat蛋白相互作用,影响病毒基因表达。此外,TARBP1可能参与microRNA加工和RNA干扰途径。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 TARBP1在多种癌症中表达异常,可能通过调控RNA代谢影响肿瘤发生发展。 较强研究证据
HIV-1感染 TARBP1与HIV-1 Tat蛋白相互作用,影响病毒基因表达。 已明确致病机制
神经系统疾病 TARBP1在脑组织中高表达,可能参与神经发育和功能。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,导致蛋白功能丧失或减弱。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,导致蛋白获得新功能或活性增强。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,突变蛋白干扰正常蛋白功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003725 - double-stranded RNA binding • GO:0005515 - protein binding
• GO:0005634 - nucleus • GO:0005737 - cytoplasm

相关通路

hsa03018 - RNA degradation
hsa05164 - Influenza A

蛋白质功能简介

TARBP1蛋白含有双链RNA结合域,参与RNA代谢和基因调控。该蛋白与HIV-1 Tat蛋白相互作用,影响病毒基因表达。TARBP1可能参与microRNA加工和RNA干扰途径,在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。

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