TBC1D13基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
TBC1D13编码TBC结构域蛋白,参与Rab GTPase信号调控,与多种疾病及癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TBC1D13 |
|---|---|
| 基因全名 | TBC1 domain family member 13 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9q34.3 |
| NCBI Gene ID | 54662 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54662 |
| Ensembl ID | ENSG00000107104 |
| UniProt ID | Q9P2N5 |
| OMIM ID | 610808 |
| HGNC ID | 25605 |
| 基因别名 | FLJ12684, MGC138373 |
基因功能与研究简介
TBC1D13(TBC1 domain family member 13)编码一个含有TBC(Tre-2/Bub2/Cdc16)结构域的蛋白质,该结构域具有Rab GTPase激活蛋白(GAP)活性。TBC1D13通过调控Rab蛋白的GTP水解活性,参与细胞内囊泡运输、信号转导等过程。研究表明,TBC1D13在多种组织中表达,并与某些癌症和遗传性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | TBC1D13在多种癌症中表达异常,可能通过调控Rab蛋白影响肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭。 | 较强研究证据 |
| 遗传性疾病 | 暂无明确证据表明TBC1D13直接导致遗传病,但可能作为修饰基因参与疾病进程。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但需进一步验证 |
| c.456C>T (p.Arg152Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变(Loss of Function):导致TBC1D13蛋白活性降低或缺失,可能影响Rab蛋白调控,进而干扰细胞信号通路。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变(Gain of Function):目前暂无明确证据表明TBC1D13存在此类突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变(Dominant Negative):目前暂无明确证据表明TBC1D13存在此类突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005096 GTPase activator activity | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0006886 intracellular protein transport |
相关通路
• Rab GTPase signaling pathway
• Vesicle trafficking pathway
蛋白质功能简介
TBC1D13蛋白包含TBC结构域,具有Rab GTPase激活蛋白(GAP)活性,能够催化Rab蛋白从GTP结合状态转变为GDP结合状态,从而负调控Rab蛋白活性。该蛋白可能参与调控内体运输、自噬等过程。在细胞中,TBC1D13定位于细胞质,与多种Rab蛋白相互作用。