TBC1D7基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
TBC1D7是TSC复合物的关键亚基,调控mTOR信号通路,与肿瘤和发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TBC1D7 |
|---|---|
| 基因全名 | TBC1 domain family member 7 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6p24.1 |
| NCBI Gene ID | 51256 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51256 |
| Ensembl ID | ENSG00000118526 |
| UniProt ID | Q9P0N9 |
| OMIM ID | 612651 |
| HGNC ID | 21066 |
| 基因别名 | TBC1D7, FLJ12841, MGC26577 |
基因功能与研究简介
TBC1D7(TBC1 domain family member 7)是TSC复合物的一个亚基,与TSC1和TSC2形成复合物,负调控mTORC1信号通路。TBC1D7通过其TBC结构域可能具有GTPase激活蛋白(GAP)活性,但主要功能是稳定TSC复合物并促进其功能。TBC1D7的突变或表达异常与多种疾病相关,包括癌症和发育异常。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肺癌 | TBC1D7表达下调或突变可能导致TSC复合物功能受损,mTORC1过度激活,促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | TBC1D7表达降低与肝癌进展相关,可能通过激活mTOR通路。 | 较强研究证据 |
| TBC1D7相关神经发育障碍 | TBC1D7纯合突变导致常染色体隐性遗传的神经发育障碍,表现为智力障碍、小头畸形等。 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | TBC1D7表达异常与乳腺癌预后相关,但机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2T>C (p.Met1?) | 起始密码子突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白质翻译起始失败,可能产生截短蛋白或无功能蛋白。 |
| c.118C>T (p.Arg40*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,提前终止密码子,导致蛋白质截短,可能被无义介导的mRNA降解。 |
| c.437_438del (p.Glu146fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function,移码导致蛋白质截短,功能丧失。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型突变):导致TBC1D7蛋白功能缺失或减弱,影响TSC复合物稳定性,导致mTORC1过度激活。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明TBC1D7存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明TBC1D7存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005096 GTPase activator activity |
| • GO:0031932 TSC complex | • GO:0032006 regulation of TOR signaling |
相关通路
• PI3K-Akt-mTOR signaling pathway (KEGG: hsa04151)
• mTOR signaling pathway (Reactome: R-HSA-165159)
蛋白质功能简介
TBC1D7蛋白是TSC复合物的组成部分,与TSC1和TSC2相互作用。TSC复合物作为GTPase激活蛋白(GAP)作用于Rheb,抑制mTORC1活性。TBC1D7对于TSC复合物的稳定性和功能至关重要。TBC1D7蛋白包含一个TBC结构域,可能具有Rab GAP活性,但其主要功能是作为TSC复合物的支架蛋白。
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