TBL1X基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TBL1X是Wnt/β-catenin信号通路的关键调控因子,参与转录调控和细胞分化,其突变与听力损失和智力障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TBL1X |
|---|---|
| 基因全名 | Transducin (beta)-like 1 X-linked receptor |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | Xp22.2 |
| NCBI Gene ID | 6907 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6907 |
| Ensembl ID | ENSG00000170162 |
| UniProt ID | O60907 |
| OMIM ID | 300196 |
| HGNC ID | 11586 |
| 基因别名 | TBL1, TBL1X, MGC126562, MGC126564 |
基因功能与研究简介
TBL1X基因编码一种F-box样蛋白,是SMRT/N-CoR复合物的核心组分,参与组蛋白去乙酰化和转录抑制。TBL1X在Wnt/β-catenin信号通路中作为关键调控因子,通过调节β-catenin的降解和核转位影响靶基因表达。该基因突变与X连锁听力损失(DFNX)和智力障碍相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| X连锁听力损失(DFNX) | TBL1X突变导致内耳发育异常和听觉毛细胞功能障碍,引起非综合征性听力损失。 | 已明确致病 |
| 智力障碍 | TBL1X突变影响神经元发育和突触可塑性,导致认知功能障碍。 | 具有较强研究证据 |
| 癌症相关 | TBL1X在多种癌症中表达异常,可能通过Wnt通路促进肿瘤发生,但具体机制尚在研究中。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 耳蜗 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1138C>T (p.Arg380Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1334G>A (p.Arg445His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1606C>T (p.Arg536Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白功能丧失或降低,如无义突变产生截短蛋白,影响复合物形成和转录调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明TBL1X突变导致功能获得。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):部分错义突变可能产生显性负性效应,干扰正常蛋白功能,但需进一步验证。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003712 transcription coregulator activity | • GO:0003713 transcription coactivator activity |
| • GO:0003714 transcription corepressor activity | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II |
| • GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II | • GO:0045892 negative regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0045893 positive regulation of transcription |
| • DNA-templated |
相关通路
• Wnt signaling pathway (KEGG: hsa04310)
• Notch signaling pathway (KEGG: hsa04330)
• Hedgehog signaling pathway (KEGG: hsa04340)
蛋白质功能简介
TBL1X蛋白属于F-box样蛋白家族,包含F-box结构域和多个WD40重复序列,参与蛋白-蛋白相互作用。作为SMRT/N-CoR复合物的核心组分,TBL1X通过招募组蛋白去乙酰化酶(HDAC)介导转录抑制。在Wnt信号通路中,TBL1X与β-catenin相互作用,调节其泛素化降解和核转位,从而影响靶基因表达。TBL1X在发育和细胞分化中发挥重要作用,尤其在听觉系统和神经系统中。
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