TBX4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TBX4是T-box转录因子家族成员,在肢体发育和肺发育中发挥关键作用,其突变可导致小膕窝综合征和先天性肺发育异常。

基因信息卡

基因符号 TBX4
基因全名 T-box transcription factor 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q23.2
NCBI Gene ID 9496 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9496
Ensembl ID ENSG00000121060
UniProt ID P57082
OMIM ID 601719
HGNC ID 11603
基因别名 T-box 4, TBX4, T-box transcription factor TBX4

基因功能与研究简介

TBX4基因编码T-box转录因子家族成员,该家族在胚胎发育中发挥关键作用。TBX4蛋白包含一个高度保守的DNA结合域(T-box),能够结合靶基因启动子中的T-box结合元件,调控下游基因表达。TBX4在肢体发育(尤其是后肢)和肺发育中至关重要,其功能缺失或异常可导致多种发育性疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
小膕窝综合征 TBX4基因突变导致单倍剂量不足,影响肢体发育,表现为腘窝蹼状结构、生殖器异常、面部畸形等。 已明确致病
先天性肺发育异常 TBX4突变与肺发育异常相关,包括肺泡毛细血管发育不良伴肺静脉错位(ACDMPV)等,机制涉及肺间质发育障碍。 已明确致病
肺动脉高压 TBX4突变与肺动脉高压(PAH)相关,可能通过影响肺血管发育和重塑导致疾病。 具有较强研究证据
骨骼发育异常 TBX4突变可导致股骨发育不良等骨骼异常,但证据相对有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
心脏 暂无可靠数据 低表达
肾脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
BEAS-2B 暂无可靠数据 正常肺上皮细胞
IMR-90 暂无可靠数据 肺成纤维细胞
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.918+1G>A 剪接位点突变 罕见 导致剪接异常,产生截短蛋白,功能丧失
p.Arg334Ter 无义突变 罕见 提前终止密码子,导致蛋白截短,功能丧失
p.Gly177Arg 错义突变 罕见 可能影响DNA结合域,导致功能异常
p.Leu214Pro 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数TBX4致病突变导致功能丧失(Loss of Function),包括无义突变、移码突变和剪接位点突变,导致单倍剂量不足或显性负效应。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明TBX4存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应(Dominant Negative),干扰野生型TBX4功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity • GO:0005634 nucleus
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0009952 anterior/posterior pattern specification • GO:0030326 embryonic limb morphogenesis
• GO:0060425 lung morphogenesis

相关通路

hsa05200 Pathways in cancer
hsa04390 Hippo signaling pathway
hsa04350 TGF-beta signaling pathway

蛋白质功能简介

TBX4蛋白属于T-box转录因子家族,包含一个保守的T-box DNA结合域。该蛋白在胚胎发育中调控靶基因表达,参与肢体、肺和心脏的形态发生。TBX4通过与DNA结合并与其他转录因子相互作用,调节细胞增殖和分化。其功能异常可导致发育缺陷和疾病。

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