TBX5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TBX5是心脏和上肢发育的关键转录因子,其突变导致Holt-Oram综合征,并在先天性心脏病和癌症中发挥重要作用。

基因信息卡

基因符号 TBX5
基因全名 T-box transcription factor 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q24.21
NCBI Gene ID 6910 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6910
Ensembl ID ENSG00000089022
UniProt ID Q99593
OMIM ID 601620
HGNC ID 11591
基因别名 HOS, T-box 5

基因功能与研究简介

TBX5基因编码T-box转录因子家族成员,在心脏和上肢发育中起关键作用。该蛋白通过结合DNA调控下游基因表达,参与心脏间隔形成和肢体发育。TBX5突变可导致Holt-Oram综合征,表现为先天性心脏病和上肢畸形。此外,TBX5异常表达与多种癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Holt-Oram综合征 TBX5单倍剂量不足导致心脏和上肢发育异常,呈常染色体显性遗传。 已明确致病
先天性心脏病 TBX5突变或表达异常与房间隔缺损、室间隔缺损等心脏畸形相关。 已明确致病
癌症 TBX5在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
心脏 暂无可靠数据 高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
H9c2(大鼠心肌细胞) 暂无可靠数据 常用于心脏研究
AC16(人心肌细胞) 暂无可靠数据 用于心脏研究
HEK293 暂无可靠数据 常用于过表达研究
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.373C>T (p.Arg125Trp) 错义突变 罕见 可能影响DNA结合能力,导致功能丧失
c.617G>A (p.Trp206*) 无义突变 罕见 产生截短蛋白,导致功能丧失
c.238C>T (p.Arg80*) 无义突变 罕见 产生截短蛋白,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数TBX5突变导致功能丧失,包括无义突变、移码突变和影响DNA结合的错义突变,导致单倍剂量不足。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明TBX5存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型TBX5功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding) • GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity
• RNA polymerase II-specific) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) • GO:0007507 (heart development)
• GO:0030326 (embryonic limb morphogenesis)

相关通路

hsa04350 (TGF-beta signaling pathway)
hsa05414 (Dilated cardiomyopathy)
hsa05410 (Hypertrophic cardiomyopathy)

蛋白质功能简介

TBX5蛋白由518个氨基酸组成,包含一个高度保守的T-box DNA结合结构域。该蛋白作为转录因子,通过结合靶基因启动子区域调控心脏和肢体发育相关基因的表达。TBX5与NKX2-5等蛋白协同作用,参与心脏间隔的形成。其功能异常可导致发育缺陷和疾病。

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