TCHP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TCHP(Trichoplein)是一种与纤毛形成和细胞周期调控相关的蛋白,其突变与纤毛病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TCHP |
|---|---|
| 基因全名 | Trichoplein, Keratin Filament Binding |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12q24.31 |
| NCBI Gene ID | 84260 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84260 |
| Ensembl ID | ENSG00000135446 |
| UniProt ID | Q9BT92 |
| OMIM ID | 612920 |
| HGNC ID | 25527 |
| 基因别名 | C12orf4, TCHP1 |
基因功能与研究简介
TCHP基因编码Trichoplein蛋白,该蛋白定位于中心体和纤毛基体,参与纤毛形成、细胞周期调控和微管动力学。TCHP在多种组织中表达,尤其在纤毛丰富的细胞中高表达。研究表明TCHP功能异常与纤毛病和某些癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 纤毛病 | TCHP突变可能导致纤毛形成异常,影响细胞信号传导,与纤毛病相关。 | ClinVar |
| 乳腺癌 | TCHP表达异常与乳腺癌进展相关,可能通过影响细胞周期和纤毛信号通路。 | COSMIC |
| 肾细胞癌 | TCHP在肾细胞癌中表达下调,可能参与肿瘤抑制。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.456_457insA (p.Glu153ArgfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.789G>A (p.Trp263Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致TCHP蛋白截短或降解,影响纤毛形成和细胞周期调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005814 (centriole) | • GO:0005813 (centrosome) |
| • GO:0005929 (cilium) | • GO:0007049 (cell cycle) |
| • GO:0008017 (microtubule binding) |
相关通路
• Cilium Assembly (GO:0060271)
• Cell Cycle (KEGG:04110)
蛋白质功能简介
TCHP蛋白(Trichoplein)由TCHP基因编码,包含一个N端卷曲螺旋结构域和一个C端微管结合结构域。该蛋白定位于中心体和纤毛基体,参与纤毛形成和细胞周期调控。TCHP通过与微管蛋白相互作用调节微管稳定性,并参与中心体成熟和纤毛发生。