TCIRG1基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TCIRG1编码T细胞免疫调节因子1,是V-ATP酶a3亚基,对骨吸收和免疫调节至关重要,其突变导致骨硬化症。

基因信息卡

基因符号 TCIRG1
基因全名 T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 11q13.2
NCBI Gene ID 10312 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10312
Ensembl ID ENSG00000110719
UniProt ID Q13488
OMIM ID 604592
HGNC ID 11648
基因别名 ATP6V0A3, OC-116, OPTB1, TIRC7, Vph1

基因功能与研究简介

TCIRG1(T cell immune regulator 1)编码V-ATP酶(vacuolar H+-ATPase)的a3亚基(V0 domain subunit a3),是V-ATP酶复合体的重要组成部分。该酶负责多种细胞器(如溶酶体、内体)的酸化,并在破骨细胞的骨吸收过程中发挥关键作用。TCIRG1在破骨细胞中高表达,通过酸化骨吸收陷窝,促进骨基质降解。此外,TCIRG1还参与免疫调节,影响T细胞活化。TCIRG1基因突变是常染色体隐性遗传性骨硬化症(autosomal recessive osteopetrosis, ARO)的主要病因之一,导致破骨细胞功能缺陷。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
常染色体隐性骨硬化症1型(ARO1) TCIRG1基因突变导致V-ATP酶a3亚基功能丧失,破骨细胞介导的骨吸收障碍,引起骨密度增加、骨髓腔消失、贫血、颅神经压迫等症状。 已明确致病
恶性骨硬化症(Infantile malignant osteopetrosis) TCIRG1突变是其主要病因,表现为婴儿期发病,严重骨硬化,常伴发骨髓衰竭。 已明确致病
骨质疏松症(Osteoporosis) TCIRG1基因多态性可能与骨密度降低相关,但证据尚不充分。 潜在关联
免疫缺陷 TCIRG1参与T细胞活化,其突变可能影响免疫功能,但临床证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达于破骨细胞
脾脏 暂无可靠数据 中等表达
胸腺 暂无可靠数据 中等表达
外周血 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
破骨细胞 暂无可靠数据 高表达
T细胞 暂无可靠数据 活化后表达上调
单核细胞/巨噬细胞 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.242delC (p.Pro81LeufsTer5) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.1175G>A (p.Arg392His) 错义突变 罕见 Loss of Function
c.1804C>T (p.Arg602Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.2236C>T (p.Arg746Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致V-ATP酶a3亚基缺失或功能受损,破骨细胞骨吸收能力下降。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明TCIRG1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明TCIRG1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000221 (vacuolar proton-transporting V-type ATPase • V0 domain)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0016021 (integral component of membrane) • GO:0030897 (ruffle membrane)
• GO:0042476 (odontogenesis) • GO:0045453 (bone resorption)
• GO:1902600 (proton transmembrane transport)

相关通路

hsa04970 (Salivary secretion)
hsa05120 (Epithelial cell signaling in Helicobacter pylori infection)
hsa05200 (Pathways in cancer)
hsa05322 (Systemic lupus erythematosus)
hsa05416 (Viral myocarditis)

蛋白质功能简介

TCIRG1蛋白(UniProt Q13488)是V-ATP酶V0结构域的a3亚基,分子量约93 kDa。该蛋白含有多个跨膜结构域,参与V-ATP酶复合体的组装和质子转运。在破骨细胞中,TCIRG1定位于皱褶缘膜,通过酸化骨吸收陷窝,激活基质金属蛋白酶,降解骨基质。此外,TCIRG1在免疫细胞中表达,参与T细胞活化过程中的酸性环境调节。

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